SAXSdb — 2o98

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

14-3-3-like protein C

Nicotiana tabacum

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Plasma membrane H+ ATPase × 2 （Q40409） SULFATE ION × 2 FUSICOCCIN × 2 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	1433C_TOBAC
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–242； UniProt 1–242 作者链 B； PDB构建体 1–242； UniProt 1–242

Plasma membrane H+ ATPase

Nicotiana plumbaginifolia

UniProt Q40409

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	14-3-3-like protein C × 2 （P93343） SULFATE ION × 2 FUSICOCCIN × 2 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q40409_NICPL
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–52； UniProt 389–440 作者链 Q； PDB构建体 1–52； UniProt 389–440

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2o98
沉积日期 deposition_date	2006-12-13
结构标题 title	Structure of the 14-3-3 / H+-ATPase plant complex
关键词 keywords	H, ATPase, 14-3-3, plasma membrane, electrochemical proton gradient, cell turgor, regulation, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2o98__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2o98__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2o98__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	26.97 Å
Rg（电子密度）	25.71 Å
总 Rg	26.61 Å
原子数	4686
残基数	573
排除体积	83363 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2o98__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	14-3-3-like protein C
分子量 formula_weight	27429.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	4824

MAVAPTAREENVYMAKLAEQAERYEEMVEFMEKVSNSLGSEELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEESRGNEEHVNSIREYRSKIENELSKICDGILKLLDAKLIPSAASGDSKVFYLKMKGDYHRYLAEFKTGAERKEAAESTLTAYKAAQDIATTELAPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDRACNLAKQAFDEAIAELDTLGEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQ

来源 Source

来源生物 organism	Nicotiana tabacum
通用名 common_name	common tobacco
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4097
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Plasma membrane H+ ATPase
分子量 formula_weight	6043.8 kDa
突变 mutation	T439D,V440I
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P,Q

TNFNELNQLAEEAKRRAEIARQRELHTLKGHVESVVKLKGLDIETIQQSYDI

来源 Source

来源生物 organism	Nicotiana plumbaginifolia
通用名 common_name	curled-leaved tobacco
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4092
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	FUSICOCCIN
分子量 formula_weight	680.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	127

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d2o98a_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.7 — 14-3-3 protein
家族 Family family	a.118.7.1 — 14-3-3 protein

结构域编号 domain_id	d2o98b_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.7 — 14-3-3 protein
家族 Family family	a.118.7.1 — 14-3-3 protein

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	2o98A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	190 — Delta-Endotoxin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — 14-3-3 domain

结构域编号 domain_id	2o98B00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	190 — Delta-Endotoxin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — 14-3-3 domain

结构域编号 domain_id	2o98P00
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	890 —

结构域编号 domain_id	2o98Q00
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	890 —

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晶胞边长 a length_a	114.370 Å
晶胞边长 b length_b	114.370 Å
晶胞边长 c length_c	236.790 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	32

空间群 space_group	I 41 2 2
空间群编号 int_tables_number	98
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.700 Å
最低分辨率 resolution_low	15.000 Å
R 因子 r_factor	0.1825
R_work r_work	0.1785
R_free r_free	0.2628

Structure of the 14-3-3 / H+-ATPase plant complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

14-3-3-like protein C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Plasma membrane H+ ATPase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2o98__assembly_1__model_1

2o98__assembly_1__model_1 | I(q)

2o98__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of the 14-3-3 / H+-ATPase plant complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

14-3-3-like protein C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Plasma membrane H+ ATPase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2o98__assembly_1__model_1

2o98__assembly_1__model_1 | I(q)

2o98__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)