2oa6

Aristolochene synthase from Aspergillus terreus complexed with pyrophosphate

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Aristolochene synthase

Aspergillus terreus

UniProt Q9UR08

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 BETA-MERCAPTOETHANOL × 4 MAGNESIUM ION × 3 PYROPHOSPHATE 2- × 1 GLYCEROL × 1 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9UR08_ASPTE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–320; UniProt 1–320 作者链 B; PDB构建体 1–320; UniProt 1–320 作者链 C; PDB构建体 1–320; UniProt 1–320 作者链 D; PDB构建体 1–320; UniProt 1–320

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2oa6
沉积日期 deposition_date2006-12-15
结构标题 titleAristolochene synthase from Aspergillus terreus complexed with pyrophosphate
关键词 keywordssesquiterpene cyclase, magnesium, pyrophosphate, farnesyl diphosphate, cyclization, LYASE; LYASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2oa6__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2oa6__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2oa6__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)34.40 Å
Rg(电子密度)33.91 Å
总 Rg34.35 Å
原子数9655
残基数1188
排除体积172540 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2oa6__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd2oa6a_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.128 — Terpenoid synthases
超家族 Superfamily superfamilya.128.1 — Terpenoid synthases
家族 Family familya.128.1.4 — Aristolochene/pentalenene synthase
结构域编号 domain_idd2oa6b_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.128 — Terpenoid synthases
超家族 Superfamily superfamilya.128.1 — Terpenoid synthases
家族 Family familya.128.1.4 — Aristolochene/pentalenene synthase
结构域编号 domain_idd2oa6c_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.128 — Terpenoid synthases
超家族 Superfamily superfamilya.128.1 — Terpenoid synthases
家族 Family familya.128.1.4 — Aristolochene/pentalenene synthase
结构域编号 domain_idd2oa6d_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.128 — Terpenoid synthases
超家族 Superfamily superfamilya.128.1 — Terpenoid synthases
家族 Family familya.128.1.4 — Aristolochene/pentalenene synthase

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id2oa6A00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology600 — Farnesyl Diphosphate Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Farnesyl Diphosphate Synthase
结构域编号 domain_id2oa6B00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology600 — Farnesyl Diphosphate Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Farnesyl Diphosphate Synthase
结构域编号 domain_id2oa6C00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology600 — Farnesyl Diphosphate Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Farnesyl Diphosphate Synthase
结构域编号 domain_id2oa6D00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology600 — Farnesyl Diphosphate Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Farnesyl Diphosphate Synthase
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7. 引用文献 (1)