Salmonella typhi
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 2 | 5'-D(*CP*GP*GP*AP*CP*TP*(3DR)P*AP*CP*GP*GP*G)-3' × 1 5'-D(*CP*CP*GP*TP*TP*AP*GP*TP*CP*CP*GP*C)-3' × 1 ZINC ION × 1 SODIUM ION × 1 3-METHYL-3H-PURIN-6-YLAMINE × 1 water × 3 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | Q8Z2A5_SALTI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–184； UniProt 1–184 |
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| 条目编号 entry_id | 2ofi |
| 沉积日期 deposition_date | 2007-01-03 |
| 结构标题 title | Crystal Structure of 3-methyladenine DNA Glycosylase I (TAG) bound to DNA/3mA |
| 关键词 keywords | 3-Methyladenine, DNA repair, Glycosylase, Base Excision, Helix-hairpin-Helix, 3-METHYLADENINE DNA GLYCOSYLASE I-DNA COMPLEX; 3-METHYLADENINE DNA GLYCOSYLASE I/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 19.56 Å |
| Rg（电子密度） | 18.36 Å |
| 总 Rg | 19.23 Å |
| 原子数 | 1934 |
| 残基数 | 202 |
| 排除体积 | 32895 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2ofia_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.96 — DNA-glycosylase |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.96.1 — DNA-glycosylase |
| 家族 Family family | a.96.1.4 — 3-Methyladenine DNA glycosylase I (Tag) |
| 结构域编号 domain_id | 2ofiA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 340 — Endonuclease III; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 30 — Hypothetical protein; domain 2 |