Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | SODIUM ION × 2 CYTIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | Y056_METJA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 4–138； UniProt 2–136 |
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| 条目编号 entry_id | 2oyn |
| 沉积日期 deposition_date | 2007-02-22 |
| 结构标题 title | Crystal structure of CDP-bound protein MJ0056 from Methanococcus jannaschii, Pfam DUF120 |
| 关键词 keywords | ;STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION, PSI-2, Protein Structure Initiative, New York SGX Research Center for Structural Genomics, NYSGXRC ;; STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 25.44 Å |
| Rg（电子密度） | 24.48 Å |
| 总 Rg | 24.97 Å |
| 原子数 | 2278 |
| 残基数 | 274 |
| 排除体积 | 41649 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2oyna1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.43 — Reductase/isomerase/elongation factor common domain |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.43.5 — Riboflavin kinase-like |
| 家族 Family family | b.43.5.2 — CTP-dependent riboflavin kinase-like |
| 结构域编号 domain_id | d2oyna2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 2oynA01 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 30 — Riboflavin kinase-like |