SAXSdb — 2p1l

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Apoptosis regulator Bcl-X

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Beclin 1 × 1 （Q14457） water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Beclin 1 × 1 （Q14457） water × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Beclin 1 × 1 （Q14457） water × 1	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Beclin 1 × 1 （Q14457） water × 1	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	Beclin 1 × 8 （Q14457） water × 8	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Beclin 1 × 2 （Q14457） water × 2	与蛋白数一致
7	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Beclin 1 × 2 （Q14457） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BCLX_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–26； UniProt 1–26 作者链 A； PDB构建体 27–153； UniProt 83–209 作者链 C； PDB构建体 1–26； UniProt 1–26 作者链 C； PDB构建体 27–153； UniProt 83–209 作者链 E； PDB构建体 1–26； UniProt 1–26 作者链 E； PDB构建体 27–153； UniProt 83–209 作者链 G； PDB构建体 1–26； UniProt 1–26 作者链 G； PDB构建体 27–153； UniProt 83–209

Beclin 1

Homo sapiens

UniProt Q14457

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Apoptosis regulator Bcl-X × 1 （Q07817） water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Apoptosis regulator Bcl-X × 1 （Q07817） water × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Apoptosis regulator Bcl-X × 1 （Q07817） water × 1	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Apoptosis regulator Bcl-X × 1 （Q07817） water × 1	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	Apoptosis regulator Bcl-X × 8 （Q07817） water × 8	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Apoptosis regulator Bcl-X × 2 （Q07817） water × 2	与蛋白数一致
7	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Apoptosis regulator Bcl-X × 2 （Q07817） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BCN1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 3–31； UniProt 107–135 作者链 D； PDB构建体 3–31； UniProt 107–135 作者链 F； PDB构建体 3–31； UniProt 107–135 作者链 H； PDB构建体 3–31； UniProt 107–135

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2p1l
沉积日期 deposition_date	2007-03-05
结构标题 title	Structure of the Bcl-XL:Beclin 1 complex
关键词 keywords	Apoptosis; autophagy; beclin; BH3 domain; Bcl, APOPTOSIS; APOPTOSIS
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2p1l__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2p1l__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2p1l__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	17.82 Å
Rg（电子密度）	16.71 Å
总 Rg	17.77 Å
原子数	1321
残基数	165
排除体积	23286 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2p1l__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2p1l__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`2p1l__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`2p1l__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`2p1l__assembly_5__model_1`	hexadecameric （16）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`2p1l__assembly_6__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
7	1	`2p1l__assembly_7__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Apoptosis regulator Bcl-X
分子量 formula_weight	17506.5 kDa
突变 mutation	Loop 27-82 deletion mutant
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G
原子数 atom_count	5300

MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSWSQMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQVVNELFRDGVNWGRIVAFFSFGGALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWDTFVELYGNNAAAESRKGQER

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Beclin 1
分子量 formula_weight	3381.8 kDa
突变 mutation	BH3 domain (residues 107-135)
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H

GSGTMENLSRRLKVTGDLFDIMSGQTDVDHP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	16

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d2p1la_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.1 — Toxins' membrane translocation domains
超家族 Superfamily superfamily	f.1.4 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death
家族 Family family	f.1.4.1 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death

结构域编号 domain_id	d2p1lc_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.1 — Toxins' membrane translocation domains
超家族 Superfamily superfamily	f.1.4 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death
家族 Family family	f.1.4.1 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death

结构域编号 domain_id	d2p1le_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.1 — Toxins' membrane translocation domains
超家族 Superfamily superfamily	f.1.4 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death
家族 Family family	f.1.4.1 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death

结构域编号 domain_id	d2p1lg_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.1 — Toxins' membrane translocation domains
超家族 Superfamily superfamily	f.1.4 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death
家族 Family family	f.1.4.1 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	2p1lA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

结构域编号 domain_id	2p1lC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

结构域编号 domain_id	2p1lE00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

结构域编号 domain_id	2p1lG00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

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晶胞边长 a length_a	107.940 Å
晶胞边长 b length_b	110.590 Å
晶胞边长 c length_c	100.520 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 21 21 2
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	29.730 Å
R 因子 r_factor	0.2250
R_work r_work	0.2260
R_free r_free	0.2620

Structure of the Bcl-XL:Beclin 1 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Apoptosis regulator Bcl-X

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Beclin 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2p1l__assembly_1__model_1

2p1l__assembly_1__model_1 | I(q)

2p1l__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of the Bcl-XL:Beclin 1 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Apoptosis regulator Bcl-X

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Beclin 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2p1l__assembly_1__model_1

2p1l__assembly_1__model_1 | I(q)

2p1l__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)