2pm4

Human alpha-defensin 1 (multiple Arg->Lys mutant)

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Neutrophil defensin 1 (HNP-1) (HP-1) (HP1) (Defensin, alpha 1)

Homo sapiens

UniProt P59665

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DEF1_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–30; UniProt 65–94 作者链 B; PDB构建体 1–30; UniProt 65–94

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2pm4
沉积日期 deposition_date2007-04-20
结构标题 titleHuman alpha-defensin 1 (multiple Arg->Lys mutant)
关键词 keywordsantimicrobial, defensin, mutant, ANTIMICROBIAL PROTEIN; ANTIMICROBIAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2pm4__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2pm4__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 104 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2pm4__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)11.87 Å
Rg(电子密度)10.94 Å
总 Rg12.32 Å
原子数470
残基数60
排除体积8494 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2pm4__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2pm4__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd2pm4a_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.9 — Defensin-like
超家族 Superfamily superfamilyg.9.1 — Defensin-like
家族 Family familyg.9.1.1 — Defensin
结构域编号 domain_idd2pm4b_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.9 — Defensin-like
超家族 Superfamily superfamilyg.9.1 — Defensin-like
家族 Family familyg.9.1.1 — Defensin

7. 引用文献 (1)