Bacillus subtilis
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | SODIUM ION × 1 FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 2 ACETIC ACID × 2 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 4 | SODIUM ION × 2 FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 4 ACETIC ACID × 4 water × 4 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | PHOT_BACSU |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 5–132； UniProt 20–147 作者链 B； PDB构建体 5–132； UniProt 20–147 |
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| 条目编号 entry_id | 2pr5 |
| 沉积日期 deposition_date | 2007-05-03 |
| 结构标题 title | Structural Basis for Light-dependent Signaling in the Dimeric LOV Photosensor YtvA (Dark Structure) |
| 关键词 keywords | light-oxygen-voltage, LOV, Per-Arnt-Sim, PAS, FLAVOPROTEIN, SIGNALING PROTEIN; FLAVOPROTEIN, SIGNALING PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 33.30 Å |
| Rg（电子密度） | 33.20 Å |
| 总 Rg | 33.60 Å |
| 原子数 | 4228 |
| 残基数 | 506 |
| 排除体积 | 74840 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2pr5a_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.110 — Profilin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.110.3 — PYP-like sensor domain (PAS domain) |
| 家族 Family family | d.110.3.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d2pr5b_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.110 — Profilin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.110.3 — PYP-like sensor domain (PAS domain) |
| 家族 Family family | d.110.3.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | 2pr5A00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 450 — Beta-Lactamase |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — PAS domain |
| 结构域编号 domain_id | 2pr5B00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 450 — Beta-Lactamase |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — PAS domain |