SAXSdb — 2puf

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (PURINE REPRESSOR)

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 同源多聚体蛋白 × 2 DNA 2 PDB 声明：tetrameric（4）与全部聚合物数一致	链 A； UniProt 1–340	突变：R190Q	;DNA (5'-D(TPAPCPGPCPAPAPAPCPGPTPTPTPGPCPGPT )-3') ; × 2 GUN* GUANINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；pH 7.40, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.00K	分辨率 3.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2PUF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BDH PURINE REPRESSOR MUTANT-HYPOXANTHINE-PALINDROMIC OPERATOR COMPLEX 提交 1996-07-25	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–340（340 aa）	突变：K55A	HPA HYPOXANTHINE × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å
1BDI PURINE REPRESSOR MUTANT-HYPOXANTHINE-PALINDROMIC OPERATOR COMPLEX 提交 1996-07-25	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–340（340 aa）	未记录	HPA HYPOXANTHINE × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
1DBQ DNA-BINDING REGULATORY PROTEIN 提交 1996-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 52–340（289 aa）片段：COREPRESSOR-FREE COREPRESSOR-BINDING DOMAIN 链 B 52–340（289 aa）片段：COREPRESSOR-FREE COREPRESSOR-BINDING DOMAIN	未记录	MG MAGNESIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å
1JFS PURINE REPRESSOR MUTANT-HYPOXANTHINE-PURF OPERATOR COMPLEX 提交 2001-06-21	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–340（340 aa）	突变：W147F	HPA HYPOXANTHINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；PEG 4000, ammonium phosphate, ammonium sulfate, cobalt hexammine, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.90 Å
1JFT PURINE REPRESSOR MUTANT-HYPOXANTHINE-PURF OPERATOR COMPLEX 提交 2001-06-21	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–340（340 aa）	突变：W147A	PO4 PHOSPHATE ION × 2 HPA HYPOXANTHINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 4000, ammonuim sulfate, ammonium phosphate, cobalt hexammine, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å
1JH9 PURINE REPRESSOR MUTANT-HYPOXANTHINE-PURF OPERATOR COMPLEX 提交 2001-06-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–340（340 aa）	突变：W147R	PO4 PHOSPHATE ION × 4 HPA HYPOXANTHINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 4000, ammonium sulfate, ammonium phosphate, cobalt hexammine, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.55 Å
1JHZ Purine Repressor Mutant Corepressor Binding Domain Structure 提交 2001-06-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 52–340（289 aa）片段：COREPRESSOR-FREE COREPRESSOR BINDING DOMAIN (Residues 53-341) 链 B 52–340（289 aa）片段：COREPRESSOR-FREE COREPRESSOR BINDING DOMAIN (Residues 53-341)	突变：W147F 突变：W147F	MG MAGNESIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；298 K；PEG 600, magnesium chloride, Tris HCl, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.40 Å
1PNR PURINE REPRESSOR-HYPOXANTHINE-PURF-OPERATOR COMPLEX 提交 1995-03-29	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–340（340 aa）	未记录	HPA HYPOXANTHINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.00K	分辨率 2.70 Å
1PRU PURINE REPRESSOR DNA-BINDING DOMAIN DNA BINDING 提交 1995-05-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–55（55 aa）片段：DNA-BINDING	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1PRV PURINE REPRESSOR DNA-BINDING DOMAIN DNA BINDING 提交 1995-05-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–55（55 aa）片段：DNA-BINDING	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1QP0 PURINE REPRESSOR-HYPOXANTHINE-PALINDROMIC OPERATOR COMPLEX 提交 1999-06-01	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–340（340 aa）	未记录	HPA HYPOXANTHINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 4000, (NH4)2SO4, [Co(NH3)6]Cl3, Na2SO4, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.90 Å
1QP4 PURINE REPRESSOR-HYPOXANTHINE-PALINDROMIC OPERATOR COMPLEX 提交 1999-06-01	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–340（340 aa）	未记录	HPA HYPOXANTHINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 4000, (NH4)2SO4, [CO(NH3)6]CL3, NA2SO4, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å
1QP7 PURINE REPRESSOR MUTANT-HYPOXANTHINE-PALINDROMIC OPERATOR COMPLEX 提交 1999-06-01	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–340（340 aa）	突变：K55A	HPA HYPOXANTHINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 4000, (NH4)3PO4, [CO(NH3)6]CL3, NA2SO4, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.90 Å
1QPZ PURINE REPRESSOR-HYPOXANTHINE-PALINDROMIC OPERATOR COMPLEX 提交 1999-06-01	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–340（340 aa）	未记录	HPA HYPOXANTHINE × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å
1QQA PURINE REPRESSOR MUTANT-HYPOXANTHINE-PALINDROMIC OPERATOR COMPLEX 提交 1999-06-01	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–340（340 aa）	突变：K55A	HPA HYPOXANTHINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 4000, (NH4)3PO4, (NH4)2SO4, [CO(NH3)6]CL3, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å
1QQB PURINE REPRESSOR MUTANT-HYPOXANTHINE-PALINDROMIC OPERATOR COMPLEX 提交 1999-06-01	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–340（340 aa）	未记录	HPA HYPOXANTHINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 4000, (NH4)3PO4, (NH4)2SO4, [CO(NH3)6]CL3, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å
1VPW STRUCTURE OF THE PURR MUTANT, L54M, BOUND TO HYPOXANTHINE AND PURF OPERATOR DNA 提交 1998-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–340（340 aa）	突变：L54M	HPA HYPOXANTHINE × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å
1WET STRUCTURE OF THE PURR-GUANINE-PURF OPERATOR COMPLEX 提交 1997-04-27	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–340（340 aa）	未记录	GUN GUANINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；pH 7.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.60 Å
1ZAY PURINE REPRESSOR-HYPOXANTHINE-MODIFIED-PURF-OPERATOR COMPLEX 提交 1998-12-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–340（340 aa）	未记录	HPA HYPOXANTHINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.70 Å
2PUA CRYSTAL STRUCTURE OF THE LACI FAMILY MEMBER, PURR, BOUND TO DNA: MINOR GROOVE BINDING BY ALPHA HELICES 提交 1997-10-04	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–340（340 aa）	突变：R190A	6MP 6-METHYLPURINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；pH 7.40, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.00K	分辨率 2.90 Å
2PUB CRYSTAL STRUCTURE OF THE LACI FAMILY MEMBER, PURR, BOUND TO DNA: MINOR GROOVE BINDING BY ALPHA HELICES 提交 1997-10-04	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–340（340 aa）	突变：R190A	ADE ADENINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；pH 7.40, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.00K	分辨率 2.70 Å
2PUC CRYSTAL STRUCTURE OF THE LACI FAMILY MEMBER, PURR, BOUND TO DNA: MINOR GROOVE BINDING BY ALPHA HELICES 提交 1997-10-04	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–340（340 aa）	突变：R190A	GUN GUANINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；pH 7.40, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.00K	分辨率 2.60 Å
2PUD CRYSTAL STRUCTURE OF THE LACI FAMILY MEMBER, PURR, BOUND TO DNA: MINOR GROOVE BINDING BY ALPHA HELICES 提交 1997-10-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–340（340 aa）	突变：R190Q	HPA HYPOXANTHINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；pH 7.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.00K	分辨率 2.60 Å
2PUE CRYSTAL STRUCTURE OF THE LACI FAMILY MEMBER, PURR, BOUND TO DNA: MINOR GROOVE BINDING BY ALPHA HELICES 提交 1997-10-04	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–340（340 aa）	突变：R190Q	ADE ADENINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；pH 7.40, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.00K	分辨率 2.70 Å
2PUG CRYSTAL STRUCTURE OF THE LACI FAMILY MEMBER, PURR, BOUND TO DNA: MINOR GROOVE BINDING BY ALPHA HELICES 提交 1997-10-04	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–340（340 aa）	突变：R190Q	HPA HYPOXANTHINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；pH 7.40, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.00K	分辨率 2.70 Å

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PURR_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–340； UniProt 1–340

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2puf
沉积日期 deposition_date	1997-10-04
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF THE LACI FAMILY MEMBER, PURR, BOUND TO DNA: MINOR GROOVE BINDING BY ALPHA HELICES
关键词 keywords	COMPLEX (DNA-BINDING PROTEIN-DNA), DNA-BINDING REGULATORY PROTEIN, EXTENDED COREPRESSOR SPECIFICITY, TRANSCRIPTION-DNA COMPLEX; TRANSCRIPTION/DNA
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	30.03 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	28.99 Å
零角强度 I(0) i0	36626900.00
分子量 molecular_weight	43118.0 kDa
排除体积 excluded_volume	52290 Å³
包络体积 envelope_volume	69200 Å³
水化壳体积 shell_volume	22692 Å³
包络直径 envelope_diameter	106.5 Å
壳层 Rg shell_rg	32.26 Å
包络 Rg envelope_rg	29.34 Å
形状 Rg shape_rg	28.94 Å
总 Rg total_rg	29.46 Å
总原子数 total_atoms	3006
残基数 n_residues	355
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	101.8 Å
Rg (实空间) rg_real	30.39 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.93 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.6630e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.3460e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	30.24 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	36620000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8139
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	25.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.528
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.505
角度范围 angular_range	— – 0.2650 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha	5016000.0000
实空间数据点数 n_real_points	54
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.692; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.540; Smooth: 0.961

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(TPAPCPGPCPAPAPAPCPGPTPTPTPGPCPGP*T )-3') ;
分子量 formula_weight	5202.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	B
原子数 atom_count	3041

TACGCAAACGTTTGCGT

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	PROTEIN (PURINE REPRESSOR)
分子量 formula_weight	38062.5 kDa
突变 mutation	R190Q
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

ATIKDVAKRANVSTTTVSHVINKTRFVAEETRNAVWAAIKELHYSPSAVARSLKVNHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKRVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDWGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLEQNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYRR

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	GUANINE
分子量 formula_weight	151.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	35

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d2pufa1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.35 — lambda repressor-like DNA-binding domains
超家族 Superfamily superfamily	a.35.1 — lambda repressor-like DNA-binding domains
家族 Family family	a.35.1.5 — GalR/LacI-like bacterial regulator

结构域编号 domain_id	d2pufa2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.93 — Periplasmic binding protein-like I
超家族 Superfamily superfamily	c.93.1 — Periplasmic binding protein-like I
家族 Family family	c.93.1.1 — L-arabinose binding protein-like

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	2pufA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	260 — 434 Repressor (Amino-terminal Domain)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — lambda repressor-like DNA-binding domains

结构域编号 domain_id	2pufA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	2pufA03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

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8. 引用文献 (2)

▶

晶胞边长 a length_a	175.920 Å
晶胞边长 b length_b	95.050 Å
晶胞边长 c length_c	81.590 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 2 2 21
空间群编号 int_tables_number	20
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	10.000 Å
R 因子 r_factor	0.2220
R_work r_work	—
R_free r_free	—

fit	/app/data/saxs_computation/pu/2puf/2puf.fit
pddf	/app/data/pr_computation/pu/2puf/2puf.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/pu/2puf/2puf.dat

CRYSTAL STRUCTURE OF THE LACI FAMILY MEMBER, PURR, BOUND TO DNA: MINOR GROOVE BINDING BY ALPHA HELICES

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (PURINE REPRESSOR)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)