Bordetella bronchiseptica
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 2 URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | O87988_BORBR |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 21–330； UniProt 1–310 作者链 B； PDB构建体 21–330； UniProt 1–310 |
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| 条目编号 entry_id | 2pzl |
| 沉积日期 deposition_date | 2007-05-18 |
| 结构标题 title | Crystal structure of the Bordetella bronchiseptica enzyme WbmG in complex with NAD and UDP |
| 关键词 keywords | ROSSMANN FOLD, PROTEIN-NAD COMPLEX, PROTEIN-NUCLEOTIDE COMPLEX, Sugar Binding Protein; SUGAR BINDING PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 27.68 Å |
| Rg（电子密度） | 27.29 Å |
| 总 Rg | 27.93 Å |
| 原子数 | 4783 |
| 残基数 | 619 |
| 排除体积 | 85067 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2pzla1 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains |
| 家族 Family family | c.2.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d2pzla2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d2pzlb1 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains |
| 家族 Family family | c.2.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d2pzlb2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 2pzlA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain |
| 结构域编号 domain_id | 2pzlB00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain |