2q1z

Crystal Structure of Rhodobacter sphaeroides SigE in complex with the anti-sigma ChrR

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RpoE, ECF SigE

Rhodobacter sphaeroides

UniProt Q3IYV6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Anti-Sigma factor ChrR, transcriptional activator ChrR × 1 (P40685) ZINC ION × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Anti-Sigma factor ChrR, transcriptional activator ChrR × 1 (P40685) ZINC ION × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q3IYV6_RHOS4
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 4–184; UniProt 1–181 作者链 C; PDB构建体 4–184; UniProt 1–181

Anti-Sigma factor ChrR, transcriptional activator ChrR

Rhodobacter sphaeroides

UniProt P40685

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 RpoE, ECF SigE × 1 (Q3IYV6) ZINC ION × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 RpoE, ECF SigE × 1 (Q3IYV6) ZINC ION × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CHRR_RHOS4
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195 作者链 D; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2q1z
沉积日期 deposition_date2007-05-25
结构标题 titleCrystal Structure of Rhodobacter sphaeroides SigE in complex with the anti-sigma ChrR
关键词 keywordsECF sigma factor, anti-sigma factor, cupin fold, Zinc binding transcription factor, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2q1z__assembly_1__model_2

Assembly 1 · Model 2 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2q1z__assembly_1__model_2 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2q1z__assembly_1__model_2 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)22.00 Å
Rg(电子密度)20.90 Å
总 Rg21.61 Å
原子数2668
残基数361
排除体积46836 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2q1z__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2q1z__assembly_1__model_2 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2q1z__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 2 2q1z__assembly_2__model_2 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id2q1zB01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1320 — Anti-sigma factor, zinc-finger domain
结构域编号 domain_id2q1zB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Jelly Rolls
结构域编号 domain_id2q1zD01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1320 — Anti-sigma factor, zinc-finger domain
结构域编号 domain_id2q1zD02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Jelly Rolls
▶

7. 引用文献 (1)