SAXSdb — 2q3j

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ferrochelatase

Bacillus subtilis

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 2–310	突变：H183A	MG MAGNESIUM ION × 1 H02 N-METHYL PROTOPORPHYRIN IX 2,4-DISULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；298 K；25-30 % PEG 2000, 0.2 M MgCl2, 0.1 M TRIS-HCL, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.39 Å R-free 0.228

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2Q3J	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AK1 FERROCHELATASE FROM BACILLUS SUBTILIS 提交 1997-05-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–310（310 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 seeded；pH 8.5；CRYSTALS GROW IN 30% PEG 2000, 0.2 M MGCL2 0.1 M TRIS-HCL, PH 8.5. THESE WERE VORTEXED AND USED AS SEEDS FOR LARGE SINGLE CRYSTALS IN: 27% PEG 2000, 0.2 M MGCL2, 0.05% NAN3, 0.1 M TRIS-HCL, PH 8.5, seeded	分辨率 1.90 Å R-free 0.243
1C1H CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS SUBTILIS FERROCHELATASE IN COMPLEX WITH N-METHYL MESOPORPHYRIN 提交 1999-07-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–310（310 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 MMP N-METHYLMESOPORPHYRIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；PEG 2000, MAGNESIUM CHLORIDE, TRIS-HCL, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 1.90 Å R-free 0.231
1C9E STRUCTURE OF FERROCHELATASE WITH COPPER(II) N-METHYLMESOPORPHYRIN COMPLEX BOUND AT THE ACTIVE SITE 提交 1999-08-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 5–310（306 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 MP1 N-METHYLMESOPORPHYRIN CONTAINING COPPER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；PEG 2000, magnesium chloride, TRIS, copper sulfate, N-methylmesoporphyrin, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K	分辨率 2.30 Å R-free 0.255
1DOZ CRYSTAL STRUCTURE OF FERROCHELATASE 提交 1999-12-22	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–310（309 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；PEG2000, MAGNESIUM CHLORIDE, TRIS, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K	分辨率 1.80 Å R-free 0.216
1LD3 Crystal Structure of B. subilis ferrochelatase with Zn(2+) bound at the active site. 提交 2002-04-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–310（310 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 2000, magnesium chloride, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.60 Å R-free 0.274
1N0I Crystal Structure of Ferrochelatase with Cadmium bound at active site 提交 2002-10-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–310（310 aa）	未记录	CD CADMIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；298 K；PEG2000, magnesium chloride, tris, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.273
2AC2 Crystal structure of the Tyr13Phe mutant variant of Bacillus subtilis Ferrochelatase with Zn(2+) bound at the active site 提交 2005-07-18	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–310（309 aa）	突变：Y13F	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；288 K；PEG 2000, magnesium chloride, tris, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, temperature 288K	分辨率 2.50 Å R-free 0.257
2AC4 Crystal structure of the His183Cys mutant variant of Bacillus subtilis Ferrochelatase 提交 2005-07-18	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–310（309 aa）	突变：H183C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；298 K；PEG 2000, magnesium chloride, tris, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.276
2H1V Crystal structure of the Lys87Ala mutant variant of Bacillus subtilis ferrochelatase 提交 2006-05-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–310（310 aa）	突变：K87A	MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；288 K；25-30% PEG 2000, 0.2 M magnesium chloride, 0.1 M Tris-HCl, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, temperature 288K	分辨率 1.20 Å R-free 0.173
2H1W Crystal structure of the His183Ala mutant variant of Bacillus subtilis ferrochelatase 提交 2006-05-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–310（310 aa）	突变：H183A	FE2 FE (II) ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；288 K；25-30 % PEG2000, 0.2 M magnesium chloride, 0.1 M Tris-HCl, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, temperature 288K	分辨率 2.60 Å R-free 0.259
2HK6 Crystal Structure of B. subtilis ferrochelatase with Iron bound at the active site 提交 2006-07-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–310（310 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；288 K；25% PEG 2000, 0.2 M MgCl2, 0.1 M Tris-HCl , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 288K	分辨率 1.71 Å R-free 0.220
2Q2N Crystal structure of Bacillus subtilis ferrochelatase in complex with deuteroporphyrin IX 2,4-disulfonic acid dihydrochloride 提交 2007-05-29	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–310（309 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 H01 PROTOPORPHYRIN IX 2,4-DISULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；30% PEG 2000, 0.1M Tris/HCl pH 8, 0.2M magnesium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.250
2Q2O Crystal structure of H183C Bacillus subtilis ferrochelatase in complex with deuteroporphyrin IX 2,4-disulfonic acid dihydrochloride 提交 2007-05-29	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–310（309 aa）	突变：H183C	MG MAGNESIUM ION × 1 H01 PROTOPORPHYRIN IX 2,4-DISULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；30% PEG 2000, 0.1M Tris/HCl pH 8, 0.2M magnesium chloride, 0.1M spermin, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.219
3GOQ Crystal structure of the Tyr13Met variant of Bacillus subtilis ferrochelatase 提交 2009-03-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–310（310 aa）	突变：Y13M	MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；298 K；25-30 % PEG 2000, 0.2 M MgCl2, 0.1 M TRIS-HCL, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.232
3M4Z Crystal Structure of B. subtilis ferrochelatase with Cobalt bound at the active site 提交 2010-03-12	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–310（309 aa）	未记录	CO COBALT (II) ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；25% PEG 2000, 0.2M MgCl2, 0.1M Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.94 Å R-free 0.199
9KTA Bacillus subtilis CpfC (HemH) Y13C variant 提交 2024-12-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–310（310 aa）	突变：Y13C	MG MAGNESIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M MgCl2, 0.05M Bis-Tris, 12.5%(w/v) PEG3350	分辨率 1.00 Å R-free 0.190
9KTB Bacillus subtilis CpfC (HemH) Y13C variant modified with bromobimane 提交 2024-12-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–310（310 aa）	突变：Y13C	9UM 3-(bromomethyl)-2,5,6-trimethyl-1H,7H-pyrazolo[1,2-a]pyrazole-1,7-dione × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M MgCl2, 0.1M Bis-Tris, 25%(w/v) PEG3000	分辨率 1.13 Å R-free 0.188
9KTC Mn(II)-bound CpfC (HemH) Y13C variant modified with bromobimane 提交 2024-12-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–310（310 aa）	突变：Y13C	9UM 3-(bromomethyl)-2,5,6-trimethyl-1H,7H-pyrazolo[1,2-a]pyrazole-1,7-dione × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 3 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M MgCl2, 0.1M Bis-Tris, 30%(w/v) PEG3350, 4.5 mM MnCl2	分辨率 1.50 Å R-free 0.246
9KTD Fe(II)-bound CpfC (HemH) Y13C variant modified with bromobimane 提交 2024-12-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–310（310 aa）	突变：Y13C	MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 5 9UM 3-(bromomethyl)-2,5,6-trimethyl-1H,7H-pyrazolo[1,2-a]pyrazole-1,7-dione × 1 FE2 FE (II) ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M MgCl2, 0.1M Bis-Tris, 30%(w/v) PEG3350, 4.5 mM Fe(NH4)2(SO4)2	分辨率 1.38 Å R-free 0.207
9KTE Co(II)-bound CpfC (HemH) Y13C variant modified with bromobimane 提交 2024-12-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–310（310 aa）	突变：Y13C	CO COBALT (II) ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 3 9UM 3-(bromomethyl)-2,5,6-trimethyl-1H,7H-pyrazolo[1,2-a]pyrazole-1,7-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M MgCl2, 0.1M Bis-Tris, 25%(w/v) PEG4000	分辨率 1.46 Å R-free 0.196
9KTF Ni(II)-bound Bacillus subtilis CpfC (HemH) Y13C variant modified with bromobimane 提交 2024-12-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–310（310 aa）	突变：Y13C	9UM 3-(bromomethyl)-2,5,6-trimethyl-1H,7H-pyrazolo[1,2-a]pyrazole-1,7-dione × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 NI NICKEL (II) ION × 2 CL CHLORIDE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M MgCl2, 0.1M Bis-Tris, 25%(w/v) PEG4000, 4.5 mM NiCl2	分辨率 1.44 Å R-free 0.192
9KTG Cu(II)-bound CpfC (HemH) Y13C variant modified with bromobimane 提交 2024-12-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–310（310 aa）	突变：Y13C	9UM 3-(bromomethyl)-2,5,6-trimethyl-1H,7H-pyrazolo[1,2-a]pyrazole-1,7-dione × 1 CU COPPER (II) ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M MgCl2, 0.1M Bis-Tris, 30%(w/v) PEG3350, 4.5 mM CuCl2	分辨率 1.44 Å R-free 0.197
9KTH Zn(II)-bound CpfC (HemH) Y13C variant modified with bromobimane 提交 2024-12-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–310（310 aa）	突变：Y13C	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 3 9UM 3-(bromomethyl)-2,5,6-trimethyl-1H,7H-pyrazolo[1,2-a]pyrazole-1,7-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M MgCl2, 0.1M Bis-Tris, 30%(w/v) PEG3350	分辨率 1.90 Å R-free 0.247

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HEMH_BACSU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–309； UniProt 2–310

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2q3j
沉积日期 deposition_date	2007-05-30
结构标题 title	Crystal structure of the His183Ala variant of Bacillus subtilis ferrochelatase in complex with N-Methyl Mesoporphyrin
关键词 keywords	ROSSMANN FOLD; PI-HELIX; N-METHYL MESOPORPHYRIN IX; N-MeMP, LYASE; LYASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	21.05 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	19.68 Å
零角强度 I(0) i0	20861600.00
分子量 molecular_weight	35362.0 kDa
排除体积 excluded_volume	44421 Å³
包络体积 envelope_volume	50602 Å³
水化壳体积 shell_volume	21462 Å³
包络直径 envelope_diameter	69.3 Å
壳层 Rg shell_rg	26.25 Å
包络 Rg envelope_rg	19.93 Å
形状 Rg shape_rg	19.65 Å
总 Rg total_rg	20.65 Å
总原子数 total_atoms	2499
残基数 n_residues	306
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	68.9 Å
Rg (实空间) rg_real	20.96 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.41 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.0860e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.7350e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	20.98 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	20860000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8864
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	26.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.241
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.336
角度范围 angular_range	— – 0.3800 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	4103000.0000
实空间数据点数 n_real_points	70
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.855; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.955

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Ferrochelatase
分子量 formula_weight	35191.4 kDa
EC 编号 ec_number	4.99.1.1
突变 mutation	H183A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2645

SRKKMGLLVMAYGTPYKEEDIERYYTHIRRGRKPEPEMLQDLKDRYEAIGGISPLAQITEQQAHNLEQHLNEIQDEITFKAYIGLKHIEPFIEDAVAEMHKDGITEAVSIVLAPHFSTFSVQSYNKRAKEEAEKLGGLTITSVESWYDEPKFVTYWVDRVKETYASMPEDERENAMLIVSAASLPEKIKEFGDPYPDQLHESAKLIAEGAGVSEYAVGWQSEGNTPDPWLGPDVQDLTRDLFEQKGYQAFVYVPVGFVADHLEVLYDNDYECKVVTDDIGASYYRPEMPNAKPEFIDALATVVLKKLGR

来源 Source

来源生物 organism	Bacillus subtilis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1423
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	N-METHYL PROTOPORPHYRIN IX 2,4-DISULFONIC ACID
分子量 formula_weight	582.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	146

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d2q3ja_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.92 — Chelatase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.92.1 — Chelatase
家族 Family family	c.92.1.1 — Ferrochelatase

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	2q3jA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1400 —

结构域编号 domain_id	2q3jA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1400 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	49.780 Å
晶胞边长 b length_b	58.570 Å
晶胞边长 c length_c	97.830 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.390 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.1829
R_work r_work	0.1829
R_free r_free	0.2283

fit	/app/data/saxs_computation/q3/2q3j/2q3j.fit
pddf	/app/data/pr_computation/q3/2q3j/2q3j.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/q3/2q3j/2q3j.dat

Crystal structure of the His183Ala variant of Bacillus subtilis ferrochelatase in complex with N-Methyl Mesoporphyrin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ferrochelatase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction