Arabidopsis thaliana
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | MAGNESIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 7 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | MAGNESIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 6 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | AGUA_ARATH |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–383； UniProt 1–383 作者链 B； PDB构建体 1–383； UniProt 1–383 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
| 条目编号 entry_id | 2q3u |
| 沉积日期 deposition_date | 2007-05-30 |
| 结构标题 title | Ensemble refinement of the protein crystal structure of gene product from Arabidopsis thaliana At5g08170, agmatine iminohydrolase |
| 关键词 keywords | ;Ensemble Refinement, Refinement Methodology Development, At5g08170, POLYAMINE BIOSYNTHESIS, AGMATINE IMINOHYDROLASE, AIH, AGMATINE DEIMINASE, N-CARBAMOYLPUTRESCINE, PUTRESCINE, Structural Genomics, Protein Structure Initiative, PSI, Center for Eukaryotic Structural Genomics, CESG, HYDROLASE ;; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 3 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 20.31 Å |
| Rg（电子密度） | 19.25 Å |
| 总 Rg | 20.11 Å |
| 原子数 | 2944 |
| 残基数 | 358 |
| 排除体积 | 51871 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 2q3u__assembly_1__model_1 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 2q3u__assembly_1__model_2 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 2q3u__assembly_1__model_3 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 2q3u__assembly_1__model_4 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 5 | 2q3u__assembly_1__model_5 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 6 | 2q3u__assembly_1__model_6 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 7 | 2q3u__assembly_1__model_7 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 8 | 2q3u__assembly_1__model_8 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 2 | 1 | 2q3u__assembly_2__model_1 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 2 | 2 | 2q3u__assembly_2__model_2 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 2 | 3 | 2q3u__assembly_2__model_3 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 2 | 4 | 2q3u__assembly_2__model_4 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 2 | 5 | 2q3u__assembly_2__model_5 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 2 | 6 | 2q3u__assembly_2__model_6 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 2 | 7 | 2q3u__assembly_2__model_7 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 2 | 8 | 2q3u__assembly_2__model_8 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 结构域编号 domain_id | d2q3ua_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.126 — Pentein, beta/alpha-propeller |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.126.1 — Pentein |
| 家族 Family family | d.126.1.6 — Porphyromonas-type peptidylarginine deiminase |
| 结构域编号 domain_id | d2q3ub_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.126 — Pentein, beta/alpha-propeller |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.126.1 — Pentein |
| 家族 Family family | d.126.1.6 — Porphyromonas-type peptidylarginine deiminase |
| 结构域编号 domain_id | 2q3uA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 75 — 5-stranded Propeller |
| 拓扑 Topology topology | 10 — L-arginine/glycine Amidinotransferase; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — L-arginine/glycine Amidinotransferase; Chain A |
| 结构域编号 domain_id | 2q3uB00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 75 — 5-stranded Propeller |
| 拓扑 Topology topology | 10 — L-arginine/glycine Amidinotransferase; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — L-arginine/glycine Amidinotransferase; Chain A |