Protein At5g01750
Arabidopsis thaliana
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | Y5175_ARATH |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–217； UniProt 1–217 |
2q4m
Ensemble refinement of the crystal structure of protein from Arabidopsis thaliana At5g01750
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 2q4m |
| 沉积日期 deposition_date | 2007-05-31 |
| 结构标题 title | Ensemble refinement of the crystal structure of protein from Arabidopsis thaliana At5g01750 |
| 关键词 keywords | ;Ensemble Refinement, Refinement Methodology Development, AT5G01750, PFAM PF01167, TULP, Structural Genomics, Protein Structure Initiative, PSI, Center for Eukaryotic Structural Genomics, CESG, UNKNOWN FUNCTION ;; STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
2q4m__assembly_1__model_9
Assembly 1 · Model 9 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
2q4m__assembly_1__model_9 | I(q)
2q4m__assembly_1__model_9 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 16.30 Å |
| Rg（电子密度） | 14.80 Å |
| 总 Rg | 15.99 Å |
| 原子数 | 1291 |
| 残基数 | 160 |
| 排除体积 | 23088 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 2q4m__assembly_1__model_1 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 2q4m__assembly_1__model_2 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 2q4m__assembly_1__model_3 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 2q4m__assembly_1__model_4 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 5 | 2q4m__assembly_1__model_5 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 6 | 2q4m__assembly_1__model_6 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 7 | 2q4m__assembly_1__model_7 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 8 | 2q4m__assembly_1__model_8 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 9 | 2q4m__assembly_1__model_9 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 10 | 2q4m__assembly_1__model_10 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 11 | 2q4m__assembly_1__model_11 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 12 | 2q4m__assembly_1__model_12 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 13 | 2q4m__assembly_1__model_13 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 14 | 2q4m__assembly_1__model_14 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 15 | 2q4m__assembly_1__model_15 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 16 | 2q4m__assembly_1__model_16 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains
SCOP 2.08 (1 domains)
| 结构域编号 domain_id | d2q4ma_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.23 — Tubby C-terminal domain-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.23.1 — Tubby C-terminal domain-like |
| 家族 Family family | d.23.1.2 — At5g01750-like |
CATH v4.4 (1 domains)
| 结构域编号 domain_id | 2q4mA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 160 — Porin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 200 — LURP1-related |