2q6n

Structure of Cytochrome P450 2B4 with Bound 1-(4-cholorophenyl)imidazole

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytochrome P450 2B4

Oryctolagus cuniculus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 1-(4-CHLOROPHENYL)-1H-IMIDAZOLE × 1	与蛋白数一致
2	蛋白单体	单体	蛋白 1	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 1-(4-CHLOROPHENYL)-1H-IMIDAZOLE × 1	与蛋白数一致
3	蛋白单体	单体	蛋白 1	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 1-(4-CHLOROPHENYL)-1H-IMIDAZOLE × 1	与蛋白数一致
4	蛋白单体	单体	蛋白 1	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 1-(4-CHLOROPHENYL)-1H-IMIDAZOLE × 1	与蛋白数一致
5	蛋白单体	单体	蛋白 1	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 1-(4-CHLOROPHENYL)-1H-IMIDAZOLE × 1	与蛋白数一致
6	蛋白单体	单体	蛋白 1	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 1-(4-CHLOROPHENYL)-1H-IMIDAZOLE × 1	与蛋白数一致
7	蛋白单体	单体	蛋白 1	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 1-(4-CHLOROPHENYL)-1H-IMIDAZOLE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CP2B4_RABIT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–472； UniProt 1–491 作者链 B； PDB构建体 1–472； UniProt 1–491 作者链 C； PDB构建体 1–472； UniProt 1–491 作者链 D； PDB构建体 1–472； UniProt 1–491 作者链 E； PDB构建体 1–472； UniProt 1–491 作者链 F； PDB构建体 1–472； UniProt 1–491 作者链 G； PDB构建体 1–472； UniProt 1–491

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2q6n
沉积日期 deposition_date	2007-06-05
结构标题 title	Structure of Cytochrome P450 2B4 with Bound 1-(4-cholorophenyl)imidazole
关键词 keywords	p450, Monooxygenase, Oxidoreductase, membrane protein, CYP 2B4, CYP LM2; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2q6n__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2q6n__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2q6n__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	23.40 Å
Rg（电子密度）	22.19 Å
总 Rg	23.13 Å
原子数	3789
残基数	465
排除体积	67845 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2q6n__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2q6n__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`2q6n__assembly_3__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`2q6n__assembly_4__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`2q6n__assembly_5__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`2q6n__assembly_6__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
7	1	`2q6n__assembly_7__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Cytochrome P450 2B4
分子量 formula_weight	54445.4 kDa
EC 编号 ec_number	1.14.14.1
突变 mutation	E2A, G22K, H23K, P24T, K25S, A26S, H27K, R29K, P221S, H226Y
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	7

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G
原子数 atom_count	26523

MAKKTSSKGKLPPGPSPLPVLGNLLQMDRKGLLRSFLRLREKYGDVFTVYLGSRPVVVLCGTDAIREALVDQAEAFSGRGKIAVVDPIFQGYGVIFANGERWRALRRFSLATMRDFGMGKRSVEERIQEEARCLVEELRKSKGALLDNTLLFHSITSNIICSIVFGKRFDYKDPVFLRLLDLFFQSFSLISSFSSQVFELFSGFLKYFPGTHRQIYRNLQEINTFIGQSVEKHRATLDPSNPRDFIDVYLLRMEKDKSDPSSEFHHQNLILTVLSLFFAGTETTSTTLRYGFLLMLKYPHVTERVQKEIEQVIGSHRPPALDDRAKMPYTDAVIHEIQRLGDLIPFGVPHTVTKDTQFRGYVIPKNTEVFPVLSSALHDPRYFETPNTFNPGHFLDANGALKRNEGFMPFSLGKRICLGEGIARTELFLFFTTILQNFSIASPVPPEDIDLTPRESGVGNVPPSYQIRFLARHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Oryctolagus cuniculus
通用名 common_name	rabbit
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9986
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	1-(4-CHLOROPHENYL)-1H-IMIDAZOLE
分子量 formula_weight	178.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 21 domains

SCOP 2.08 (14 domains)

结构域编号 domain_id	d2q6na1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.104 — Cytochrome P450
超家族 Superfamily superfamily	a.104.1 — Cytochrome P450
家族 Family family	a.104.1.1 — Cytochrome P450

结构域编号 domain_id	d2q6na2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2q6nb1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.104 — Cytochrome P450
超家族 Superfamily superfamily	a.104.1 — Cytochrome P450
家族 Family family	a.104.1.1 — Cytochrome P450

结构域编号 domain_id	d2q6nb2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2q6nc1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.104 — Cytochrome P450
超家族 Superfamily superfamily	a.104.1 — Cytochrome P450
家族 Family family	a.104.1.1 — Cytochrome P450

结构域编号 domain_id	d2q6nc2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2q6nd1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.104 — Cytochrome P450
超家族 Superfamily superfamily	a.104.1 — Cytochrome P450
家族 Family family	a.104.1.1 — Cytochrome P450

结构域编号 domain_id	d2q6nd2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2q6ne1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.104 — Cytochrome P450
超家族 Superfamily superfamily	a.104.1 — Cytochrome P450
家族 Family family	a.104.1.1 — Cytochrome P450

结构域编号 domain_id	d2q6ne2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2q6nf1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.104 — Cytochrome P450
超家族 Superfamily superfamily	a.104.1 — Cytochrome P450
家族 Family family	a.104.1.1 — Cytochrome P450

结构域编号 domain_id	d2q6nf2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2q6ng1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.104 — Cytochrome P450
超家族 Superfamily superfamily	a.104.1 — Cytochrome P450
家族 Family family	a.104.1.1 — Cytochrome P450

结构域编号 domain_id	d2q6ng2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (7 domains)

结构域编号 domain_id	2q6nA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	630 — Cytochrome p450
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome P450

结构域编号 domain_id	2q6nB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	630 — Cytochrome p450
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome P450

结构域编号 domain_id	2q6nC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	630 — Cytochrome p450
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome P450

结构域编号 domain_id	2q6nD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	630 — Cytochrome p450
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome P450

结构域编号 domain_id	2q6nE00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	630 — Cytochrome p450
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome P450

结构域编号 domain_id	2q6nF00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	630 — Cytochrome p450
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome P450

结构域编号 domain_id	2q6nG00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	630 — Cytochrome p450
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome P450

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晶胞边长 a length_a	140.000 Å
晶胞边长 b length_b	147.310 Å
晶胞边长 c length_c	238.490 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	28

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.200 Å
最低分辨率 resolution_low	30.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2330
R_free r_free	0.3110

Structure of Cytochrome P450 2B4 with Bound 1-(4-cholorophenyl)imidazole

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytochrome P450 2B4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2q6n__assembly_1__model_1

2q6n__assembly_1__model_1 | I(q)

2q6n__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 21 domains

SCOP 2.08 (14 domains)

CATH v4.4 (7 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of Cytochrome P450 2B4 with Bound 1-(4-cholorophenyl)imidazole

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytochrome P450 2B4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2q6n__assembly_1__model_1

2q6n__assembly_1__model_1 | I(q)

2q6n__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 21 domains

SCOP 2.08 (14 domains)

CATH v4.4 (7 domains)

7. 引用文献 (1)