SAXSdb — 2q7q

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Aralkylamine dehydrogenase light chain

Alcaligenes faecalis

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Aralkylamine dehydrogenase heavy chain × 2 （P84888） 1-(4-CHLOROPHENYL)METHANAMINE × 2 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AAUA_ALCFA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–124； UniProt 59–182 作者链 H； PDB构建体 1–124； UniProt 59–182

Aralkylamine dehydrogenase heavy chain

Alcaligenes faecalis

UniProt P84888

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Aralkylamine dehydrogenase light chain × 2 （P84887） 1-(4-CHLOROPHENYL)METHANAMINE × 2 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AAUB_ALCFA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–361； UniProt 30–390 作者链 B； PDB构建体 1–361； UniProt 30–390

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2q7q
沉积日期 deposition_date	2007-06-07
结构标题 title	Crystal structure of Alcaligenes faecalis AADH in complex with p-chlorobenzylamine.
关键词 keywords	Oxidoreductase, TTQ; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2q7q__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2q7q__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2q7q__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	30.56 Å
Rg（电子密度）	30.04 Å
总 Rg	30.65 Å
原子数	7344
残基数	943
排除体积	129230 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2q7q__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Aralkylamine dehydrogenase light chain
分子量 formula_weight	13713.2 kDa
EC 编号 ec_number	1.4.99.4
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,H
原子数 atom_count	8572

HISLNPDLANEDEVNSCDYWRHCAVDGFLCSCCGGTTTTCPPGSTPSPISWIGTCHNPHDGKDYLISYHDCCGKTACGRCQCNTQTRERPGYEFFLHNDVNWCMANENSTFHCTTSVLVGLAKN

来源 Source

来源生物 organism	Alcaligenes faecalis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	511
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Aralkylamine dehydrogenase heavy chain
分子量 formula_weight	40014.2 kDa
EC 编号 ec_number	1.4.99.4
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B

REVLTGGHSVSAPQENRIYVMDSVFMHLTESRVHVYDYTNGKFLGMVPTAFNGHVQVSNDGKKIYTMTTYHERITRGKRSDVVEVWDADKLTFEKEISLPPKRVQGLNYDGLFRQTTDGKFIVLQNASPATSIGIVDVAKGDYVEDVTAAAGCWSVIPQPNRPRSFMTICGDGGLLTINLGEDGKVASQSRSKQMFSVKDDPIFIAPALDKDKAHFVSYYGNVYSADFSGDEVKVDGPWSLLNDEDKAKNWVPGGYNLVGLHRASGRMYVFMHPDGKEGTHKFPAAEIWVMDTKTKQRVARIPGRDALSMTIDQQRNLMLTLDGGNVNVYDISQPEPKLLRTIEGAAEASLQVQFHPVGGV

来源 Source

来源生物 organism	Alcaligenes faecalis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	511
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	1-(4-CHLOROPHENYL)METHANAMINE
分子量 formula_weight	141.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1220

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d2q7qd_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.21 — Methylamine dehydrogenase, L chain
超家族 Superfamily superfamily	g.21.1 — Methylamine dehydrogenase, L chain
家族 Family family	g.21.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2q7qh_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.21 — Methylamine dehydrogenase, L chain
超家族 Superfamily superfamily	g.21.1 — Methylamine dehydrogenase, L chain
家族 Family family	g.21.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	2q7qA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase

结构域编号 domain_id	2q7qB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase

结构域编号 domain_id	2q7qD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	30 — Electron Transport Ethylamine Dehydrogenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Methylamine/Aralkylamine dehydrogenase light chain

结构域编号 domain_id	2q7qH00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	30 — Electron Transport Ethylamine Dehydrogenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Methylamine/Aralkylamine dehydrogenase light chain

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晶胞边长 a length_a	91.541 Å
晶胞边长 b length_b	96.762 Å
晶胞边长 c length_c	120.130 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.600 Å
最低分辨率 resolution_low	15.000 Å
R 因子 r_factor	0.1660
R_work r_work	0.1650
R_free r_free	0.1930

Crystal structure of Alcaligenes faecalis AADH in complex with p-chlorobenzylamine.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Aralkylamine dehydrogenase light chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Aralkylamine dehydrogenase heavy chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2q7q__assembly_1__model_1

2q7q__assembly_1__model_1 | I(q)

2q7q__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of Alcaligenes faecalis AADH in complex with p-chlorobenzylamine.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Aralkylamine dehydrogenase light chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Aralkylamine dehydrogenase heavy chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2q7q__assembly_1__model_1

2q7q__assembly_1__model_1 | I(q)

2q7q__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)