SAXSdb — 2qaa

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Streptogrisin-B

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 115–299	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 TYR TYROSINE × 1 LEU LEUCINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 ACY ACETIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；298 K；10 mg/mL SGPB in 10 mM MgCl2 1.0 M Li2SO4, 0.1 M HEPES-NaOH pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.23 Å R-free 0.127
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 115–299	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 6 TYR TYROSINE × 1 LEU LEUCINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 3 ACY ACETIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；298 K；10 mg/mL SGPB in 10 mM MgCl2 1.0 M Li2SO4, 0.1 M HEPES-NaOH pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.23 Å R-free 0.127
3	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 115–299 链 B； UniProt 115–299	未记录	SO4 SULFATE ION × 60 CL CHLORIDE ION × 120 TYR TYROSINE × 24 LEU LEUCINE × 24 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 48 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 12 GOL GLYCEROL × 48 ACY ACETIC ACID × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；298 K；10 mg/mL SGPB in 10 mM MgCl2 1.0 M Li2SO4, 0.1 M HEPES-NaOH pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.23 Å R-free 0.127

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2QAA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1CSO CRYSTAL STRUCTURE OF THE OMTKY3 P1 VARIANT OMTKY3-ILE18I IN COMPLEX WITH SGPB 提交 1999-08-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；PEG 4000 sodium potassium phosphate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.90 Å
1CT0 CRYSTAL STRUCTURE OF THE OMTKY3 P1 VARIANT OMTKY3-SER18I IN COMPLEX WITH SGPB 提交 1999-08-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；298 K；PEG 4000 sodium potassium phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 1.80 Å
1CT2 CRYSTAL STRUCTURE OF THE OMTKY3 P1 VARIANT OMTKY3-THR18I IN COMPLEX WITH SGPB 提交 1999-08-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；298 K；PEG 4000 sodium potassium phosphate , pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.65 Å
1CT4 CRYSTAL STRUCTURE OF THE OMTKY3 P1 VARIANT OMTKY3-VAL18I IN COMPLEX WITH SGPB 提交 1999-08-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；298 K；PEG 4000 sodium potassium phosphate, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å
1DS2 CRYSTAL STRUCTURE OF SGPB:OMTKY3-COO-LEU18I 提交 2000-01-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；298 K；PEG 4000, sodium potassium phosphate, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 1.70 Å
1SGD ASP 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B AT PH 6.5 提交 1999-03-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.4M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE BUFFER AT PH 6.5	分辨率 1.80 Å
1SGE GLU 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B AT PH 6.5 提交 1999-03-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.4 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE buffer AT PH 6.5	分辨率 1.80 Å
1SGN ASN 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B 提交 1999-03-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；2% PEG 6000, 50MM SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE BUFFER AT PH 6.5, pH 6.50	分辨率 1.80 Å
1SGP ALA 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B 提交 1995-05-26	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.40 Å
1SGQ GLY 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B 提交 1995-05-26	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
1SGR LEU 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B 提交 1995-05-26	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å
1SGY TYR 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B AT PH 6.5 提交 1999-03-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.4 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE buffer AT PH 6.5	分辨率 1.80 Å
2GKV Crystal structure of the SGPB:P14'-Ala32 OMTKY3-del(1-5) complex 提交 2006-04-03	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.2M Na acetate trihydrate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 26% w/v PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 1.70 Å R-free 0.248
2NU0 Molecular structures of the complexes of SGPB with OMTKY3 aromatic P1 variants Trp18I, His18I, Phe18I, and Tyr18I 提交 2006-11-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）片段：residues 115-299	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；298 K；PEG 4000, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.95 Å
2NU1 Molecular structures of the complexes of SGPB with OMTKY3 aromatic P1 variants Trp18I, His18I, Phe18I and Tyr18I 提交 2006-11-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）片段：residues 115-299	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；298 K；PEG 4000, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å
2NU2 Accommodation of positively-charged residues in a hydrophobic specificity pocket: Crystal structures of SGPB in complex with OMTKY3 variants Lys18I and Arg18I 提交 2006-11-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）片段：residues 115-299	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；298 K；PEG 4000, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.65 Å
2NU3 Accommodation of positively-charged residues in a hydrophobic specificity pocket: Crystal structures of SGPB in complex with OMTKY3 variants Lys18I and Arg18I 提交 2006-11-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）片段：residues 115-299	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；298 K；PEG 4000, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å
2NU4 Accommodation of positively-charged residues in a hydrophobic specificity pocket: Crystal structures of SGPB in complex with OMTKY3 variants Lys18I and Arg18I 提交 2006-11-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）片段：residues 115-299	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；PEG 4000, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE at pH 7.1 24h before data collection, crystal was transferred to PEG4000, NaKHPO4 at pH 10.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.75 Å
2QA9 Crystal structure of the second tetrahedral intermediates of SGPB at pH 4.2 提交 2007-06-14	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；298 K；10 mg/mL SGPB in 10 mM MgCl2 0.7 M KH2PO4 pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.18 Å R-free 0.182
2QA9 Crystal structure of the second tetrahedral intermediates of SGPB at pH 4.2 提交 2007-06-14	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；298 K；10 mg/mL SGPB in 10 mM MgCl2 0.7 M KH2PO4 pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.18 Å R-free 0.182
2SGD ASP 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B AT PH 10.7 提交 1999-03-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 10.7；0.4M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE BUFFER AT PH 10.7	分辨率 1.80 Å
2SGE GLU 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B AT PH 10.7 提交 1999-03-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 10.7；0.4M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE BUFFER AT PH 10.7	分辨率 1.80 Å
2SGF PHE 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B 提交 1999-03-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.4 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE AT PH 6.5	分辨率 1.75 Å
2SGP PRO 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B AT PH 6.5 提交 1999-03-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.4 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE BUFFER AT PH 6.5, pH 6.50	分辨率 1.80 Å
2SGQ GLN 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B AT PH 6.5 提交 1999-03-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.4 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE buffer AT PH 6.5	分辨率 1.80 Å
3SGB STRUCTURE OF THE COMPLEX OF STREPTOMYCES GRISEUS PROTEASE B AND THE THIRD DOMAIN OF THE TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR AT 1.8 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1983-01-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å
3SGQ GLN 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B AT PH 10.7 提交 1999-03-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 10.7；0.4 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE buffer AT PH 10.7	分辨率 1.80 Å
4SGB STRUCTURE OF THE COMPLEX OF STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B AND POLYPEPTIDE CHYMOTRYPSIN INHIBITOR-1 FROM RUSSET BURBANK POTATO TUBERS AT 2.1 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1989-09-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–299（185 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å

共 27 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PRTB_STRGR
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–185； UniProt 115–299 作者链 B； PDB构建体 1–185； UniProt 115–299

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2qaa
沉积日期 deposition_date	2007-06-14
结构标题 title	Crystal structure of the second tetrahedral intermediates of SGPB at pH 7.3
关键词 keywords	CHYMOTRYPSIN-TYPE SERINE PEPTIDASE, SECOND TETRAHEDRAL INTERMEDIATES, SINGLE AMINO ACIDS, BETA BARRELS, ALPHA HELIX, Hydrolase; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	22.74 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	21.76 Å
零角强度 I(0) i0	31851500.00
分子量 molecular_weight	39517.0 kDa
排除体积 excluded_volume	47717 Å³
包络体积 envelope_volume	54021 Å³
水化壳体积 shell_volume	21386 Å³
包络直径 envelope_diameter	78.8 Å
壳层 Rg shell_rg	27.62 Å
包络 Rg envelope_rg	21.93 Å
形状 Rg shape_rg	21.70 Å
总 Rg total_rg	22.58 Å
总原子数 total_atoms	2746
残基数 n_residues	356
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	76.6 Å
Rg (实空间) rg_real	22.78 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.45 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.1850e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.0540e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	22.78 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	31850000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8723
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	23.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.414
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.360
角度范围 angular_range	— – 0.3500 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	7501000.0000
实空间数据点数 n_real_points	67
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.807; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.961; Smooth: 0.953

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Streptogrisin-B
分子量 formula_weight	18653.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.81
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	3397

ISGGDAIYSSTGRCSLGFNVRSGSTYYFLTAGHCTDGATTWWANSARTTVLGTTSGSSFPNNDYGIVRYTNTTIPKDGTVGGQDITSAANATVGMAVTRRGSTTGTHSGSVTALNATVNYGGGDVVYGMIRTNVCAEPGDSGGPLYSGTRAIGLTSGGSGNCSSGGTTFFQPVTEALSAYGVSVY

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	TYROSINE
分子量 formula_weight	181.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	LEUCINE
分子量 formula_weight	131.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID
分子量 formula_weight	238.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	ACETIC ACID
分子量 formula_weight	60.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 10 Entity 10 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	521

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d2qaaa_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.47 — Trypsin-like serine proteases
超家族 Superfamily superfamily	b.47.1 — Trypsin-like serine proteases
家族 Family family	b.47.1.1 — Prokaryotic proteases

结构域编号 domain_id	d2qaab_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.47 — Trypsin-like serine proteases
超家族 Superfamily superfamily	b.47.1 — Trypsin-like serine proteases
家族 Family family	b.47.1.1 — Prokaryotic proteases

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	2qaaA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	2qaaA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	2qaaB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	2qaaB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	142.286 Å
晶胞边长 b length_b	142.286 Å
晶胞边长 c length_c	142.286 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	48

空间群 space_group	I 2 3
空间群编号 int_tables_number	197
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.230 Å
最低分辨率 resolution_low	40.000 Å
R 因子 r_factor	0.1133
R_work r_work	0.1125
R_free r_free	0.1271

fit	/app/data/saxs_computation/qa/2qaa/2qaa.fit
pddf	/app/data/pr_computation/qa/2qaa/2qaa.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/qa/2qaa/2qaa.dat

Crystal structure of the second tetrahedral intermediates of SGPB at pH 7.3