Amphitrite ornata
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | AMMONIUM ION × 2 SULFATE ION × 3 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 OXYGEN MOLECULE × 2 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | Q9NAV8_9ANNE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–138； UniProt 1–138 作者链 B； PDB构建体 1–138； UniProt 1–138 |
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| 条目编号 entry_id | 2qfn |
| 沉积日期 deposition_date | 2007-06-27 |
| 结构标题 title | X-ray Crystal Structure Analysis of the Binding Site in the Ferric and Oxyferrous Forms of the Recombinant Heme Dehaloperoxidase Cloned from Amphitrite ornata |
| 关键词 keywords | Dehaloperoxidase, DHP, globin, heme protein, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 23.51 Å |
| Rg（电子密度） | 22.82 Å |
| 总 Rg | 23.70 Å |
| 原子数 | 2289 |
| 残基数 | 274 |
| 排除体积 | 40529 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2qfna_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.1 — Globin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.1.1 — Globin-like |
| 家族 Family family | a.1.1.2 — Globins |
| 结构域编号 domain_id | d2qfnb_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.1 — Globin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.1.1 — Globin-like |
| 家族 Family family | a.1.1.2 — Globins |
| 结构域编号 domain_id | 2qfnA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 490 — Globin-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Globins |
| 结构域编号 domain_id | 2qfnB00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 490 — Globin-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Globins |