2qgg

X-Ray structure of the protein Q6F7I0 from Acinetobacter calcoaceticus AmMS 248. Northeast Structural Genomics Consortium target AsR73.

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

16S rRNA-processing protein rimM

Acinetobacter calcoaceticus

UniProt Q6F7I0

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 POTASSIUM ION × 1 UNKNOWN LIGAND × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RIMM_ACIAD
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–182; UniProt 1–182

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2qgg
沉积日期 deposition_date2007-06-28
结构标题 titleX-Ray structure of the protein Q6F7I0 from Acinetobacter calcoaceticus AmMS 248. Northeast Structural Genomics Consortium target AsR73.
关键词 keywords;NESG, AsR73, Acinetobacter calcoaceticus, Structural Genomics, PSI-2, Protein Structure Initiative, Northeast Structural Genomics Consortium, UNKNOWN FUNCTION ;; STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2qgg__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2qgg__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2qgg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)17.92 Å
Rg(电子密度)16.80 Å
总 Rg17.79 Å
原子数1425
残基数172
排除体积25259 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2qgg__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd2qgga1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.43 — Reductase/isomerase/elongation factor common domain
超家族 Superfamily superfamilyb.43.3 — Translation proteins
家族 Family familyb.43.3.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd2qgga2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.41 — PRC-barrel domain
超家族 Superfamily superfamilyb.41.1 — PRC-barrel domain
家族 Family familyb.41.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id2qggA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — RimM
结构域编号 domain_id2qggA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily240 — PRC-barrel domain
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7. 引用文献 (1)