2qts

Structure of an acid-sensing ion channel 1 at 1.9 A resolution and low pH

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Acid-sensing ion channel

Gallus gallus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	同源多聚体	蛋白 3 其他聚合物 3	alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 3 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CHLORIDE ION × 3 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 3	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CHLORIDE ION × 3 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q1XA76_CHICK
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–438； UniProt 26–463 作者链 B； PDB构建体 1–438； UniProt 26–463 作者链 C； PDB构建体 1–438； UniProt 26–463 作者链 D； PDB构建体 1–438； UniProt 26–463 作者链 E； PDB构建体 1–438； UniProt 26–463 作者链 F； PDB构建体 1–438； UniProt 26–463

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2qts
沉积日期 deposition_date	2007-08-02
结构标题 title	Structure of an acid-sensing ion channel 1 at 1.9 A resolution and low pH
关键词 keywords	acid-sensing, ion channel, trimer, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2qts__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2qts__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2qts__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	36.04 Å
Rg（电子密度）	36.48 Å
总 Rg	36.80 Å
原子数	10085
残基数	1248
排除体积	180200 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2qts__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2qts__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Acid-sensing ion channel
分子量 formula_weight	50154.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F
原子数 atom_count	22034

STLHGISHIFSYERLSLKRVVWALCFMGSLALLALVCTNRIQYYFLYPHVTKLDEVAATRLTFPAVTFCNLNEFRFSRVTKNDLYHAGELLALLNNRYEIPDTQTADEKQLEILQDKANFRNFKPKPFNMLEFYDRAGHDIREMLLSCFFRGEQCSPEDFKVVFTRYGKCYTFNAGQDGKPRLITMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPLIDQLGFGVAPGFQTFVSCQEQRLIYLPPPWGDCKATTGDSEFYDTYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLVEKDNEYCVCEMPCNVTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKYNKSEQYIGENILVLDIFFEALNYETIEQKKAYEVAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHR

来源 Source

来源生物 organism	Gallus gallus
通用名 common_name	chicken
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9031
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 branched

描述 description	alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	342.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1729

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

CATH v4.4 (24 domains)

结构域编号 domain_id	2qtsA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	770 — YojJ-like

结构域编号 domain_id	2qtsA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	470 — Acid-sensing ion channels like fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acid-sensing ion channels like domains

结构域编号 domain_id	2qtsA03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3590 — acid-sensing ion channel 1 fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — acid-sensing ion channel 1 domain

结构域编号 domain_id	2qtsA04
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	820 — Acid-sensing ion channel domain

结构域编号 domain_id	2qtsB01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	770 — YojJ-like

结构域编号 domain_id	2qtsB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	470 — Acid-sensing ion channels like fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acid-sensing ion channels like domains

结构域编号 domain_id	2qtsB03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3590 — acid-sensing ion channel 1 fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — acid-sensing ion channel 1 domain

结构域编号 domain_id	2qtsB04
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	820 — Acid-sensing ion channel domain

结构域编号 domain_id	2qtsC01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	770 — YojJ-like

结构域编号 domain_id	2qtsC02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	470 — Acid-sensing ion channels like fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acid-sensing ion channels like domains

结构域编号 domain_id	2qtsC03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3590 — acid-sensing ion channel 1 fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — acid-sensing ion channel 1 domain

结构域编号 domain_id	2qtsC04
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	820 — Acid-sensing ion channel domain

结构域编号 domain_id	2qtsD01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	770 — YojJ-like

结构域编号 domain_id	2qtsD02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	470 — Acid-sensing ion channels like fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acid-sensing ion channels like domains

结构域编号 domain_id	2qtsD03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3590 — acid-sensing ion channel 1 fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — acid-sensing ion channel 1 domain

结构域编号 domain_id	2qtsD04
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	820 — Acid-sensing ion channel domain

结构域编号 domain_id	2qtsE01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	770 — YojJ-like

结构域编号 domain_id	2qtsE02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	470 — Acid-sensing ion channels like fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acid-sensing ion channels like domains

结构域编号 domain_id	2qtsE03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3590 — acid-sensing ion channel 1 fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — acid-sensing ion channel 1 domain

结构域编号 domain_id	2qtsE04
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	820 — Acid-sensing ion channel domain

结构域编号 domain_id	2qtsF01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	770 — YojJ-like

结构域编号 domain_id	2qtsF02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	470 — Acid-sensing ion channels like fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acid-sensing ion channels like domains

结构域编号 domain_id	2qtsF03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3590 — acid-sensing ion channel 1 fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — acid-sensing ion channel 1 domain

结构域编号 domain_id	2qtsF04
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	820 — Acid-sensing ion channel domain

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晶胞边长 a length_a	124.252 Å
晶胞边长 b length_b	110.781 Å
晶胞边长 c length_c	149.891 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	97.54 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.900 Å
最低分辨率 resolution_low	30.000 Å
R 因子 r_factor	0.2081
R_work r_work	0.2080
R_free r_free	0.2330

Structure of an acid-sensing ion channel 1 at 1.9 A resolution and low pH

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Acid-sensing ion channel

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2qts__assembly_2__model_1

2qts__assembly_2__model_1 | I(q)

2qts__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 branched

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

CATH v4.4 (24 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of an acid-sensing ion channel 1 at 1.9 A resolution and low pH

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Acid-sensing ion channel

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2qts__assembly_2__model_1

2qts__assembly_2__model_1 | I(q)

2qts__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 branched

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

CATH v4.4 (24 domains)

7. 引用文献 (1)