2rij

Crystal structure of a putative 2,3,4,5-tetrahydropyridine-2-carboxylate n-succinyltransferase (cj1605c, dapd) from campylobacter jejuni at 1.90 A resolution

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Putative 2,3,4,5-tetrahydropyridine-2-carboxylate N- succinyltransferase

Campylobacter jejuni

UniProt Q0P823

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 6 CHLORIDE ION × 12 CITRIC ACID × 6 GLYCEROL × 6 water × 6 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 CHLORIDE ION × 6 CITRIC ACID × 3 GLYCEROL × 3 water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q0P823_CAMJE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 2–387; UniProt 1–386

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2rij
沉积日期 deposition_date2007-10-11
结构标题 titleCrystal structure of a putative 2,3,4,5-tetrahydropyridine-2-carboxylate n-succinyltransferase (cj1605c, dapd) from campylobacter jejuni at 1.90 A resolution
关键词 keywordsStructural genomics, Joint Center for Structural Genomics, JCSG, Protein Structure Initiative, PSI-2, transferase; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2rij__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2rij__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2rij__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)53.14 Å
Rg(电子密度)53.64 Å
总 Rg53.63 Å
原子数17546
残基数2232
排除体积316860 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2rij__assembly_1__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2rij__assembly_2__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id2rijA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily2010 —
结构域编号 domain_id2rijA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily70 — Trimeric LpxA-like enzymes
结构域编号 domain_id2rijA03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture160 — 3 Solenoid
拓扑 Topology topology10 — UDP N-Acetylglucosamine Acyltransferase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hexapeptide repeat proteins
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7. 引用文献 (1)