2rnm

Structure of The HET-s(218-289) prion in its amyloid form obtained by solid-state NMR

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Small s protein

Podospora anserina

UniProt Q03689

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 5 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q03689_PODAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 2–73; UniProt 218–289 作者链 B; PDB构建体 2–73; UniProt 218–289 作者链 C; PDB构建体 2–73; UniProt 218–289 作者链 D; PDB构建体 2–73; UniProt 218–289 作者链 E; PDB构建体 2–73; UniProt 218–289

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2rnm
沉积日期 deposition_date2008-01-24
结构标题 titleStructure of The HET-s(218-289) prion in its amyloid form obtained by solid-state NMR
关键词 keywords;HET-s(218-289), beta-solenoid, prion, amyloid fibril, parallel beta-sheets, hydrophobic core, salt bridges, asparagine ladders, beta-helix, PROTEIN FIBRIL ;; PROTEIN FIBRIL
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2rnm__assembly_1__model_3

Assembly 1 · Model 3 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2rnm__assembly_1__model_3 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2rnm__assembly_1__model_3 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)22.27 Å
Rg(电子密度)21.31 Å
总 Rg22.31 Å
原子数6014
残基数395
排除体积52698 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2rnm__assembly_1__model_1 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2rnm__assembly_1__model_2 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2rnm__assembly_1__model_3 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2rnm__assembly_1__model_4 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2rnm__assembly_1__model_5 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2rnm__assembly_1__model_6 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2rnm__assembly_1__model_7 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2rnm__assembly_1__model_8 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2rnm__assembly_1__model_9 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2rnm__assembly_1__model_10 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 2rnm__assembly_1__model_11 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 2rnm__assembly_1__model_12 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 2rnm__assembly_1__model_13 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 2rnm__assembly_1__model_14 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 2rnm__assembly_1__model_15 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 2rnm__assembly_1__model_16 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 2rnm__assembly_1__model_17 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 2rnm__assembly_1__model_18 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 2rnm__assembly_1__model_19 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 2rnm__assembly_1__model_20 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 引用文献 (1)