← 返回搜索
2tbv

STRUCTURE OF TOMATO BUSHY STUNT VIRUS. V. COAT PROTEIN SEQUENCE DETERMINATION AND ITS STRUCTURAL IMPLICATIONS

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TOMATO BUSHY STUNT VIRUS

Tomato bushy stunt virus

UniProt P11795

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 180 CALCIUM ION × 360 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 CALCIUM ION × 6 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 15 CALCIUM ION × 30 与蛋白数一致
4 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 18 CALCIUM ION × 36 与蛋白数一致
5 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 CALCIUM ION × 6 与蛋白数一致
6 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 15 CALCIUM ION × 30 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体
2tbv 2tbv 2tbv 2tbv 2tbv 2tbv

共 6 个 assembly

异源或核酸复合物

暂无

查看构建体与数据证据
UniProt名称 COAT_TBSVB
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387 作者链 B； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387 作者链 C； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2tbv
沉积日期 deposition_date1984-06-22
结构标题 titleSTRUCTURE OF TOMATO BUSHY STUNT VIRUS. V. COAT PROTEIN SEQUENCE DETERMINATION AND ITS STRUCTURAL IMPLICATIONS
关键词 keywordsVIRUS, Icosahedral virus; VIRUS
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2tbv__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2tbv__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 1011 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2tbv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）0.00 Å
Rg（电子密度）141.80 Å
总 Rg142.00 Å
原子数396360
残基数53400
排除体积7092200 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2tbv__assembly_1__model_1 180-MERIC （180） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2tbv__assembly_2__model_1 trimeric （3） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
3 1 2tbv__assembly_3__model_1 pentadecameric （15） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
4 1 2tbv__assembly_4__model_1 octadecameric （18） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
5 1 2tbv__assembly_5__model_1 trimeric （3） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
6 1 2tbv__assembly_6__model_1 pentadecameric （15） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd2tbva_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family familyb.121.4.7 — Tombusviridae-like VP
结构域编号 domain_idd2tbvb_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family familyb.121.4.7 — Tombusviridae-like VP
结构域编号 domain_idd2tbvc_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family familyb.121.4.7 — Tombusviridae-like VP

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id2tbvA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id2tbvB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id2tbvC00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
▶

7. 引用文献 (7)