SAXSdb — 2v1s

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MITOCHONDRIAL IMPORT RECEPTOR SUBUNIT TOM20 HOMOLOG

RATTUS NORVEGICUS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	ALDEHYDE DEHYDROGENASE × 1 （P11884） water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	ALDEHYDE DEHYDROGENASE × 1 （P11884） water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	ALDEHYDE DEHYDROGENASE × 1 （P11884） water × 2	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	ALDEHYDE DEHYDROGENASE × 1 （P11884） water × 2	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	ALDEHYDE DEHYDROGENASE × 1 （P11884） water × 2	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	ALDEHYDE DEHYDROGENASE × 1 （P11884） water × 2	与蛋白数一致
7	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	ALDEHYDE DEHYDROGENASE × 1 （P11884） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TOM20_RAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 6–73； UniProt 59–126 作者链 B； PDB构建体 6–73； UniProt 59–126 作者链 C； PDB构建体 6–73； UniProt 59–126 作者链 D； PDB构建体 6–73； UniProt 59–126 作者链 E； PDB构建体 6–73； UniProt 59–126 作者链 F； PDB构建体 6–73； UniProt 59–126 作者链 G； PDB构建体 6–73； UniProt 59–126

ALDEHYDE DEHYDROGENASE

物种未注明

UniProt P11884

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MITOCHONDRIAL IMPORT RECEPTOR SUBUNIT TOM20 HOMOLOG × 1 （Q62760） water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MITOCHONDRIAL IMPORT RECEPTOR SUBUNIT TOM20 HOMOLOG × 1 （Q62760） water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MITOCHONDRIAL IMPORT RECEPTOR SUBUNIT TOM20 HOMOLOG × 1 （Q62760） water × 2	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MITOCHONDRIAL IMPORT RECEPTOR SUBUNIT TOM20 HOMOLOG × 1 （Q62760） water × 2	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MITOCHONDRIAL IMPORT RECEPTOR SUBUNIT TOM20 HOMOLOG × 1 （Q62760） water × 2	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MITOCHONDRIAL IMPORT RECEPTOR SUBUNIT TOM20 HOMOLOG × 1 （Q62760） water × 2	与蛋白数一致
7	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MITOCHONDRIAL IMPORT RECEPTOR SUBUNIT TOM20 HOMOLOG × 1 （Q62760） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ALDH2_RAT
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–13； UniProt 12–24 作者链 I； PDB构建体 1–13； UniProt 12–24 作者链 J； PDB构建体 1–13； UniProt 12–24 作者链 K； PDB构建体 1–13； UniProt 12–24 作者链 L； PDB构建体 1–13； UniProt 12–24 作者链 M； PDB构建体 1–13； UniProt 12–24 作者链 N； PDB构建体 1–13； UniProt 12–24

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2v1s
沉积日期 deposition_date	2007-05-29
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF RAT TOM20-ALDH PRESEQUENCE COMPLEX
关键词 keywords	;FLAVOPROTEIN, MITOCHONDRION, DISULFIDE-BOND TETHERING, STEROID BIOSYNTHESIS, PROTEIN TRANSPORT, STEROL BIOSYNTHESIS, LIPID SYNTHESIS, TRANSIT PEPTIDE, PHOSPHORYLATION, NAD, FAD, MEMBRANE, TRANSPORT, TRANSMEMBRANE, OXIDOREDUCTASE, OUTER MEMBRANE, MEMBRANE PROTEIN/OXIDOREDUCTASE ;; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2v1s__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2v1s__assembly_3__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2v1s__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	14.24 Å
Rg（电子密度）	13.10 Å
总 Rg	14.43 Å
原子数	638
残基数	81
排除体积	11510 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2v1s__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2v1s__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`2v1s__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`2v1s__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`2v1s__assembly_5__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`2v1s__assembly_6__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
7	1	`2v1s__assembly_7__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	MITOCHONDRIAL IMPORT RECEPTOR SUBUNIT TOM20 HOMOLOG
分子量 formula_weight	8022.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	7

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G
原子数 atom_count	4232

GPLGSDLKDAEAVQKFFLEEIQLGEELLAQGDYEKGVDHLTNAIAVCGQPQQLLQVLQQTLPPPVFQMLLTKL

来源 Source

来源生物 organism	RATTUS NORVEGICUS
通用名 common_name	RAT
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ALDEHYDE DEHYDROGENASE
分子量 formula_weight	1393.7 kDa
EC 编号 ec_number	1.2.1.3
突变 mutation	YES
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,I,J,K,L,M,N

GPRLSRLLSYAGC

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	377

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	2v1sA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	960 — Mitochondrial Import Receptor Subunit Tom20; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Mitochondrial outer membrane translocase complex, subunit Tom20 domain

结构域编号 domain_id	2v1sB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	960 — Mitochondrial Import Receptor Subunit Tom20; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Mitochondrial outer membrane translocase complex, subunit Tom20 domain

结构域编号 domain_id	2v1sC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	960 — Mitochondrial Import Receptor Subunit Tom20; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Mitochondrial outer membrane translocase complex, subunit Tom20 domain

结构域编号 domain_id	2v1sD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	960 — Mitochondrial Import Receptor Subunit Tom20; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Mitochondrial outer membrane translocase complex, subunit Tom20 domain

结构域编号 domain_id	2v1sE00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	960 — Mitochondrial Import Receptor Subunit Tom20; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Mitochondrial outer membrane translocase complex, subunit Tom20 domain

结构域编号 domain_id	2v1sF00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	960 — Mitochondrial Import Receptor Subunit Tom20; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Mitochondrial outer membrane translocase complex, subunit Tom20 domain

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晶胞边长 a length_a	151.781 Å
晶胞边长 b length_b	64.146 Å
晶胞边长 c length_c	68.018 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	94.70 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	28

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.050 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.2540
R_work r_work	0.2480
R_free r_free	0.3080

CRYSTAL STRUCTURE OF RAT TOM20-ALDH PRESEQUENCE COMPLEX

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MITOCHONDRIAL IMPORT RECEPTOR SUBUNIT TOM20 HOMOLOG

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ALDEHYDE DEHYDROGENASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2v1s__assembly_3__model_1

2v1s__assembly_3__model_1 | I(q)

2v1s__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)

CRYSTAL STRUCTURE OF RAT TOM20-ALDH PRESEQUENCE COMPLEX

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MITOCHONDRIAL IMPORT RECEPTOR SUBUNIT TOM20 HOMOLOG

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ALDEHYDE DEHYDROGENASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2v1s__assembly_3__model_1

2v1s__assembly_3__model_1 | I(q)

2v1s__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)