物种未注明
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 2 | ;5'-D(*TP*CP*TP*CP*CP*AP*CP*AP*GP*GP *AP*AP*AP*CP*GP*GP*AP*GP*GP*GP*GP*T)-3' ; × 1 ;5'-D(*AP*CP*CP*CP*CP*TP*CP*CP*GP*TP *TP*TP*CP*CP*TP*GP*TP*GP*GP*AP*GP*A)-3' ; × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 water × 3 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | CDC6_AERPE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–387； UniProt 9–395 |
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| 条目编号 entry_id | 2v1u |
| 沉积日期 deposition_date | 2007-05-30 |
| 结构标题 title | STRUCTURE OF THE AEROPYRUM PERNIX ORC1 PROTEIN IN COMPLEX WITH DNA |
| 关键词 keywords | DNA REPLICATION, NUCLEOTIDE-BINDING, REPLICATION, ARCHAEA, ATP-BINDING, PHOSPHORYLATION, DNA REPLICATION INITIATION; REPLICATION |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 27.64 Å |
| Rg（电子密度） | 26.46 Å |
| 总 Rg | 27.20 Å |
| 原子数 | 3943 |
| 残基数 | 426 |
| 排除体积 | 67528 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 2v1uA01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 60 — |
| 结构域编号 domain_id | 2v1uA02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases |
| 结构域编号 domain_id | 2v1uA03 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 10 — Arc Repressor Mutant, subunit A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain |