METHANOCALDOCOCCUS JANNASCHII
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–RNA | 异源复合物 | 蛋白 2 RNA 1 | SIGNAL RECOGNITION 54 KDA PROTEIN × 1 （Q57565） 7S RNA × 1 water × 3 | 与全部聚合物一致 |
| 2 | 蛋白–RNA | 异源复合物 | 蛋白 2 RNA 1 | SIGNAL RECOGNITION 54 KDA PROTEIN × 1 （Q57565） 7S RNA × 1 water × 3 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | SRP19_METJA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–87； UniProt 1–87 作者链 B； PDB构建体 1–87； UniProt 1–87 |
METHANOCALDOCOCCUS JANNASCHII
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–RNA | 异源复合物 | 蛋白 2 RNA 1 | SIGNAL RECOGNITION PARTICLE 19 KDA PROTEIN × 1 （Q58440） 7S RNA × 1 water × 3 | 与全部聚合物一致 |
| 2 | 蛋白–RNA | 异源复合物 | 蛋白 2 RNA 1 | SIGNAL RECOGNITION PARTICLE 19 KDA PROTEIN × 1 （Q58440） 7S RNA × 1 water × 3 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | SRP54_METJA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 C； PDB构建体 2–426； UniProt 3–427 作者链 D； PDB构建体 2–426； UniProt 3–427 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
| 条目编号 entry_id | 2v3c |
| 沉积日期 deposition_date | 2007-06-15 |
| 结构标题 title | Crystal structure of the SRP54-SRP19-7S.S SRP RNA complex of M. jannaschii |
| 关键词 keywords | NUCLEOTIDE-BINDING, SIGNAL RECOGNITION PARTICLE, RNA, GTP-BINDING, RNA-BINDING, RIBONUCLEOPROTEIN, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 29.72 Å |
| Rg（电子密度） | 30.64 Å |
| 总 Rg | 31.05 Å |
| 原子数 | 5939 |
| 残基数 | 587 |
| 排除体积 | 99576 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2v3ca_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.201 — SRP19 |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.201.1 — SRP19 |
| 家族 Family family | d.201.1.1 — SRP19 |
| 结构域编号 domain_id | d2v3cb_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.201 — SRP19 |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.201.1 — SRP19 |
| 家族 Family family | d.201.1.1 — SRP19 |
| 结构域编号 domain_id | 2v3cA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 56 — Phenylalanyl-tRNA Synthetase; Chain B, domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 30 — Signal recognition particle, SRP19-like subunit |
| 结构域编号 domain_id | 2v3cB00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 56 — Phenylalanyl-tRNA Synthetase; Chain B, domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 30 — Signal recognition particle, SRP19-like subunit |
| 结构域编号 domain_id | 2v3cC01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 140 — SRP54, nucleotide-binding domain |
| 结构域编号 domain_id | 2v3cC02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases |
| 结构域编号 domain_id | 2v3cC03 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 260 — 434 Repressor (Amino-terminal Domain) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 30 — Signal recognition particle, SRP54 subunit, M-domain |
| 结构域编号 domain_id | 2v3cD01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 140 — SRP54, nucleotide-binding domain |
| 结构域编号 domain_id | 2v3cD02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases |
| 结构域编号 domain_id | 2v3cD03 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 260 — 434 Repressor (Amino-terminal Domain) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 30 — Signal recognition particle, SRP54 subunit, M-domain |