TRANSLOCASE SUBUNIT SECA
ESCHERICHIA COLI
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | MALTOPORIN × 1 （Q8CVI4） | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | SECA_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–828； UniProt 9–836 |
2vda
Solution structure of the SecA-signal peptide complex
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
MALTOPORIN
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | TRANSLOCASE SUBUNIT SECA × 1 （P10408） | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | LAMB_ECOL6 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 1–7； UniProt 1–7 作者链 B； PDB构建体 11–28； UniProt 8–25 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 2vda |
| 沉积日期 deposition_date | 2007-10-01 |
| 结构标题 title | Solution structure of the SecA-signal peptide complex |
| 关键词 keywords | ;SUGAR TRANSPORT, PROTEIN TRANSPORT, PROTEIN TARGETING, TRANSMEMBRANE, OUTER MEMBRANE, SIGNAL PEPTIDE, PARAMAGNETIC RELAXATION ENHANCEMENT, TRANSLOCASE, ION TRANSPORT, TRANSLOCATION, PROTEIN SECRETION, NUCLEOTIDE-BINDING, SECA, PORIN, MEMBRANE, TRANSPORT, ATP-BINDING, HIGH MOLECULAR WEIGHT COMPLEX ;; PROTEIN TRANSPORT |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
2vda__assembly_1__model_1
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
2vda__assembly_1__model_1 | I(q)
2vda__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 35.28 Å |
| Rg（电子密度） | 35.03 Å |
| 总 Rg | 35.53 Å |
| 原子数 | 12995 |
| 残基数 | 856 |
| 排除体积 | 120700 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 2vda__assembly_1__model_1 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 2vda__assembly_1__model_2 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 2vda__assembly_1__model_3 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 2vda__assembly_1__model_4 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 5 | 2vda__assembly_1__model_5 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 6 | 2vda__assembly_1__model_6 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 7 | 2vda__assembly_1__model_7 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 8 | 2vda__assembly_1__model_8 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 9 | 2vda__assembly_1__model_9 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 10 | 2vda__assembly_1__model_10 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains
CATH v4.4 (4 domains)
| 结构域编号 domain_id | 2vdaA01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases |
| 结构域编号 domain_id | 2vdaA02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 90 — Alpha-Beta Complex |
| 拓扑 Topology topology | 1440 — Pre-protein croslinking domain of SecA |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — SecA, preprotein cross-linking domain |
| 结构域编号 domain_id | 2vdaA03 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases |
| 结构域编号 domain_id | 2vdaA04 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 3060 — Helical scaffold and wing domains of SecA |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Helical scaffold and wing domains of SecA |