SAXSdb — 2vof

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BCL-2-RELATED PROTEIN A1

MUS MUSCULUS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	BCL-2-BINDING COMPONENT 3 × 2 （Q99ML1） CHLORIDE ION × 2 water × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	BCL-2-BINDING COMPONENT 3 × 1 （Q99ML1） CHLORIDE ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	BCL-2-BINDING COMPONENT 3 × 1 （Q99ML1） CHLORIDE ION × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B2LA1_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 6–157； UniProt 1–152 作者链 C； PDB构建体 6–157； UniProt 1–152

BCL-2-BINDING COMPONENT 3

MUS MUSCULUS

UniProt Q99ML1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	BCL-2-RELATED PROTEIN A1 × 2 （Q07440） CHLORIDE ION × 2 water × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	BCL-2-RELATED PROTEIN A1 × 1 （Q07440） CHLORIDE ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	BCL-2-RELATED PROTEIN A1 × 1 （Q07440） CHLORIDE ION × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BBC3_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–26； UniProt 130–155 作者链 D； PDB构建体 1–26； UniProt 130–155

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2vof
沉积日期 deposition_date	2008-02-17
结构标题 title	Structure of mouse A1 bound to the Puma BH3-domain
关键词 keywords	BH3, BCL-2, APOPTOSIS, PRO-SURVIVAL, MITOCHONDRION, PROTEIN-PROTEIN COMPLEX; APOPTOSIS
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2vof__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2vof__assembly_3__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2vof__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	16.71 Å
Rg（电子密度）	15.35 Å
总 Rg	16.56 Å
原子数	1382
残基数	168
排除体积	24651 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2vof__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2vof__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`2vof__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	BCL-2-RELATED PROTEIN A1
分子量 formula_weight	18110.0 kDa
突变 mutation	YES
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C
原子数 atom_count	2900

GPLGSMAESELMHIHSLAEHYLQYVLQVPAFESAPSQACRVLQRVAFSVQKEVEKNLKSYLDDFHVESIDTARIIFNQVMEKEFEDGIINWGRIVTIFAFGGVLLKKLKQEQIALDVSAYKQVSSFVAEFIMNNTGEWIRQNGGWEDGFIKKFEPKS

来源 Source

来源生物 organism	MUS MUSCULUS
通用名 common_name	MOUSE
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	BCL-2-BINDING COMPONENT 3
分子量 formula_weight	3193.5 kDa
突变 mutation	YES
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D

EEEWAREIGAQLRRIADDLNAQYERR

来源 Source

来源生物 organism	MUS MUSCULUS
通用名 common_name	MOUSE
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	176

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d2vofa1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.1 — Toxins' membrane translocation domains
超家族 Superfamily superfamily	f.1.4 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death
家族 Family family	f.1.4.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2vofa2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2vofc1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.1 — Toxins' membrane translocation domains
超家族 Superfamily superfamily	f.1.4 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death
家族 Family family	f.1.4.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2vofc2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	2vofA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

结构域编号 domain_id	2vofC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

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晶胞边长 a length_a	49.640 Å
晶胞边长 b length_b	60.683 Å
晶胞边长 c length_c	59.986 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	109.53 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.800 Å
最低分辨率 resolution_low	43.980 Å
R 因子 r_factor	0.1840
R_work r_work	0.1830
R_free r_free	0.2100

Structure of mouse A1 bound to the Puma BH3-domain

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BCL-2-RELATED PROTEIN A1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

BCL-2-BINDING COMPONENT 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2vof__assembly_3__model_1

2vof__assembly_3__model_1 | I(q)

2vof__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of mouse A1 bound to the Puma BH3-domain

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BCL-2-RELATED PROTEIN A1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

BCL-2-BINDING COMPONENT 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2vof__assembly_3__model_1

2vof__assembly_3__model_1 | I(q)

2vof__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)