SAXSdb — 2vt4

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BETA1 ADRENERGIC RECEPTOR

MELEAGRIS GALLOPAVO

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	Cyanopindolol × 2 SODIUM ION × 2 octyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 6 DECANE × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	Cyanopindolol × 2 SODIUM ION × 2 octyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 6 DECANE × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白单体	单体	蛋白 1	Cyanopindolol × 1 SODIUM ION × 1 octyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 3 DECANE × 1 water × 1	与蛋白数一致
4	蛋白单体	单体	蛋白 1	Cyanopindolol × 1 SODIUM ION × 1 octyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 3 water × 1	与蛋白数一致
5	蛋白单体	单体	蛋白 1	Cyanopindolol × 1 SODIUM ION × 1 octyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 3 DECANE × 1 water × 1	与蛋白数一致
6	蛋白单体	单体	蛋白 1	Cyanopindolol × 1 SODIUM ION × 1 octyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 3 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ADRB1_MELGA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–213； UniProt 33–243 作者链 A； PDB构建体 214–218； UniProt 272–276 作者链 A； PDB构建体 219–307； UniProt 279–367 作者链 B； PDB构建体 3–213； UniProt 33–243 作者链 B； PDB构建体 214–218； UniProt 272–276 作者链 B； PDB构建体 219–307； UniProt 279–367 作者链 C； PDB构建体 3–213； UniProt 33–243 作者链 C； PDB构建体 214–218； UniProt 272–276 作者链 C； PDB构建体 219–307； UniProt 279–367 作者链 D； PDB构建体 3–213； UniProt 33–243 作者链 D； PDB构建体 214–218； UniProt 272–276 作者链 D； PDB构建体 219–307； UniProt 279–367

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2vt4
沉积日期 deposition_date	2008-05-09
结构标题 title	TURKEY BETA1 ADRENERGIC RECEPTOR WITH STABILISING MUTATIONS AND BOUND CYANOPINDOLOL
关键词 keywords	;GPCR, MEMBRANE, RECEPTOR, PALMITATE, TRANSDUCER, ANTAGONIST BOUND FORM, INTEGRAL MEMBRANE PROTEIN, G-PROTEIN COUPLED RECEPTOR, G PROTEIN COUPLED RECEPTOR, THERMOSTABILISING POINT MUTATIONS, PHOSPHOPROTEIN, SEVEN-HELIX RECEPTOR, LIPOPROTEIN, 7TM RECEPTOR, GLYCOPROTEIN, TRANSMEMBRANE ;; RECEPTOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2vt4__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2vt4__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2vt4__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	27.31 Å
Rg（电子密度）	25.99 Å
总 Rg	26.93 Å
原子数	4534
残基数	550
排除体积	83783 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2vt4__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2vt4__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`2vt4__assembly_3__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`2vt4__assembly_4__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`2vt4__assembly_5__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`2vt4__assembly_6__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	BETA1 ADRENERGIC RECEPTOR
分子量 formula_weight	35752.6 kDa
突变 mutation	YES
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	8976

MGAELLSQQWEAGMSLLMALVVLLIVAGNVLVIAAIGSTQRLQTLTNLFITSLACADLVVGLLVVPFGATLVVRGTWLWGSFLCELWTSLDVLCVTASIETLCVIAIDRYLAITSPFRYQSLMTRARAKVIICTVWAISALVSFLPIMMHWWRDEDPQALKCYQDPGCCDFVTNRAYAIASSIISFYIPLLIMIFVALRVYREAKEQIRKIDRASKRKRVMLMREHKALKTLGIIMGVFTLCWLPFFLVNIVNVFNRDLVPDWLFVAFNWLGYANSAMNPIIYCRSPDFRKAFKRLLAFPRKADRRLHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	MELEAGRIS GALLOPAVO
通用名 common_name	COMMON TURKEY
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9103
宿主生物 host_organism	TRICHOPLUSIA NI

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	Cyanopindolol
分子量 formula_weight	287.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	octyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside
分子量 formula_weight	308.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	DECANE
分子量 formula_weight	142.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	31

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d2vt4a_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.13 — Class A G protein-coupled receptor (GPCR)-like
超家族 Superfamily superfamily	f.13.1 — Class A G protein-coupled receptor (GPCR)-like
家族 Family family	f.13.1.3 — Amine receptor-like

结构域编号 domain_id	d2vt4b_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.13 — Class A G protein-coupled receptor (GPCR)-like
超家族 Superfamily superfamily	f.13.1 — Class A G protein-coupled receptor (GPCR)-like
家族 Family family	f.13.1.3 — Amine receptor-like

结构域编号 domain_id	d2vt4c_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.13 — Class A G protein-coupled receptor (GPCR)-like
超家族 Superfamily superfamily	f.13.1 — Class A G protein-coupled receptor (GPCR)-like
家族 Family family	f.13.1.3 — Amine receptor-like

结构域编号 domain_id	d2vt4d_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.13 — Class A G protein-coupled receptor (GPCR)-like
超家族 Superfamily superfamily	f.13.1 — Class A G protein-coupled receptor (GPCR)-like
家族 Family family	f.13.1.3 — Amine receptor-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	2vt4A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1070 — Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Rhodopsin 7-helix transmembrane proteins

结构域编号 domain_id	2vt4B00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1070 — Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Rhodopsin 7-helix transmembrane proteins

结构域编号 domain_id	2vt4C00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1070 — Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Rhodopsin 7-helix transmembrane proteins

结构域编号 domain_id	2vt4D00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1070 — Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Rhodopsin 7-helix transmembrane proteins

▶

晶胞边长 a length_a	55.500 Å
晶胞边长 b length_b	86.800 Å
晶胞边长 c length_c	95.500 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	67.60 °
晶胞夹角 β angle_beta	73.30 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	85.80 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.700 Å
最低分辨率 resolution_low	45.100 Å
R 因子 r_factor	0.2150
R_work r_work	0.2120
R_free r_free	0.2680

TURKEY BETA1 ADRENERGIC RECEPTOR WITH STABILISING MUTATIONS AND BOUND CYANOPINDOLOL

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BETA1 ADRENERGIC RECEPTOR

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2vt4__assembly_1__model_1

2vt4__assembly_1__model_1 | I(q)

2vt4__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (2)

TURKEY BETA1 ADRENERGIC RECEPTOR WITH STABILISING MUTATIONS AND BOUND CYANOPINDOLOL

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BETA1 ADRENERGIC RECEPTOR

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2vt4__assembly_1__model_1

2vt4__assembly_1__model_1 | I(q)

2vt4__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (2)