2vxj

CRYSTAL STRUCTURE OF PA-IL LECTIN COMPLEXED WITH AGAL13BGAL14GLC AT 1.9 A RESOLUTION

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PA-I GALACTOPHILIC LECTIN

PSEUDOMONAS AERUGINOSA

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 1	与蛋白数一致
10	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
11	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
12	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 1	与蛋白数一致
13	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 2 water × 1	与蛋白数一致
14	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 1 beta-D-glucopyranose × 1 water × 1	与蛋白数一致
15	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 1	与蛋白数一致
16	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
17	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 2 water × 1	与蛋白数一致
18	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
19	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
20	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
21	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 1	与蛋白数一致
22	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 1	与蛋白数一致
23	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 2 water × 1	与蛋白数一致
24	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 1	与蛋白数一致
3	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
4	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 1	与蛋白数一致
5	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 1	与蛋白数一致
6	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
7	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 1	与蛋白数一致
8	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 1	与蛋白数一致
9	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 2 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PA1L_PSEAE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 B； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 C； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 D； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 E； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 F； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 G； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 H； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 I； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 J； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 K； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 L； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 M； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 N； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 O； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 P； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 Q； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 R； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 S； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 T； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 U； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 V； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 W； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122 作者链 X； PDB构建体 1–121； UniProt 2–122

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2vxj
沉积日期 deposition_date	2008-07-04
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF PA-IL LECTIN COMPLEXED WITH AGAL13BGAL14GLC AT 1.9 A RESOLUTION
关键词 keywords	LECTIN, GLOBOSIDE, SUGAR BINDING PROTEIN; SUGAR BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2vxj__assembly_7__model_1

Assembly 7 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2vxj__assembly_7__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2vxj__assembly_7__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	15.51 Å
Rg（电子密度）	14.32 Å
总 Rg	15.40 Å
原子数	936
残基数	121
排除体积	16469 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2vxj__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2vxj__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`2vxj__assembly_3__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`2vxj__assembly_4__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`2vxj__assembly_5__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`2vxj__assembly_6__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
7	1	`2vxj__assembly_7__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
8	1	`2vxj__assembly_8__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
9	1	`2vxj__assembly_9__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
10	1	`2vxj__assembly_10__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
11	1	`2vxj__assembly_11__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
12	1	`2vxj__assembly_12__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
13	1	`2vxj__assembly_13__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
14	1	`2vxj__assembly_14__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
15	1	`2vxj__assembly_15__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
16	1	`2vxj__assembly_16__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
17	1	`2vxj__assembly_17__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
18	1	`2vxj__assembly_18__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
19	1	`2vxj__assembly_19__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
20	1	`2vxj__assembly_20__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
21	1	`2vxj__assembly_21__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
22	1	`2vxj__assembly_22__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
23	1	`2vxj__assembly_23__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
24	1	`2vxj__assembly_24__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	PA-I GALACTOPHILIC LECTIN
分子量 formula_weight	12770.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	24

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X
原子数 atom_count	25600

AWKGEVLANNEAGQVTSIIYNPGDVITIVAAGWASYGPTQKWGPQGDREHPDQGLICHDAFCGALVMKIGNSGTIPVNTGLFRWVAPNNVQGAITLIYNDVPGTYGNNSGSFSVNIGKDQS

来源 Source

来源生物 organism	PSEUDOMONAS AERUGINOSA
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	208964
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 branched

描述 description	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	504.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	21

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	504.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 branched

描述 description	alpha-D-galactopyranose-(1-3)-beta-D-galactopyranose
分子量 formula_weight	342.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	24

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	20

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	180.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 8 Entity 8 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3046

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 48 domains

SCOP 2.08 (24 domains)

结构域编号 domain_id	d2vxja_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxjb_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxjc_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxjd_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxje_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxjf_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxjg_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxjh_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxji_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxjj_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxjk_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxjl_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxjm_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxjn_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxjo_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxjp_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxjq_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxjr_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxjs_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxjt_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxju_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxjv_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxjw_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

结构域编号 domain_id	d2vxjx_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family family	b.18.1.16 — PA-IL, galactose-binding lectin 1

CATH v4.4 (24 domains)

结构域编号 domain_id	2vxjA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjE00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjF00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjG00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjH00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjI00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjJ00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjK00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjL00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjM00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjN00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjO00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjP00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjQ00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjR00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjS00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjT00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjU00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjV00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjW00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

结构域编号 domain_id	2vxjX00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 — Galactose-binding lectin

▶

晶胞边长 a length_a	79.184 Å
晶胞边长 b length_b	86.521 Å
晶胞边长 c length_c	119.078 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	93.93 °
晶胞夹角 β angle_beta	98.16 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.08 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.900 Å
最低分辨率 resolution_low	55.000 Å
R 因子 r_factor	0.1880
R_work r_work	0.1850
R_free r_free	0.2450

CRYSTAL STRUCTURE OF PA-IL LECTIN COMPLEXED WITH AGAL13BGAL14GLC AT 1.9 A RESOLUTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PA-I GALACTOPHILIC LECTIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2vxj__assembly_7__model_1

2vxj__assembly_7__model_1 | I(q)

2vxj__assembly_7__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 branched

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 48 domains

SCOP 2.08 (24 domains)

CATH v4.4 (24 domains)

7. 引用文献 (1)

CRYSTAL STRUCTURE OF PA-IL LECTIN COMPLEXED WITH AGAL13BGAL14GLC AT 1.9 A RESOLUTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PA-I GALACTOPHILIC LECTIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2vxj__assembly_7__model_1

2vxj__assembly_7__model_1 | I(q)

2vxj__assembly_7__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 branched

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 48 domains

SCOP 2.08 (24 domains)

CATH v4.4 (24 domains)

7. 引用文献 (1)