2w1a

Non-covalent complex between dahp synthase and chorismate mutase from Mycobacterium tuberculosis with bound tsa

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

3-DEOXY-D-ARABINO-HEPTULOSONATE 7-PHOSPHATE SYNTHASE AROG

MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	CHORISMATE MUTASE × 4 （P64767） MANGANESE (II) ION × 4 SULFATE ION × 6 O-DODECANYL OCTAETHYLENE GLYCOL × 2 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 GLYCEROL × 6 8-HYDROXY-2-OXA-BICYCLO[3.3.1]NON-6-ENE-3,5-DICARBOXYLIC ACID × 4 water × 8	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	O53512_MYCTU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 11–472； UniProt 1–462 作者链 B； PDB构建体 11–472； UniProt 1–462

CHORISMATE MUTASE

MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS

UniProt P64767

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	3-DEOXY-D-ARABINO-HEPTULOSONATE 7-PHOSPHATE SYNTHASE AROG × 4 （O53512） MANGANESE (II) ION × 4 SULFATE ION × 6 O-DODECANYL OCTAETHYLENE GLYCOL × 2 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 GLYCEROL × 6 8-HYDROXY-2-OXA-BICYCLO[3.3.1]NON-6-ENE-3,5-DICARBOXYLIC ACID × 4 water × 8	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Y948_MYCTU
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–90； UniProt 16–105 作者链 D； PDB构建体 1–90； UniProt 16–105

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2w1a
沉积日期 deposition_date	2008-10-16
结构标题 title	Non-covalent complex between dahp synthase and chorismate mutase from Mycobacterium tuberculosis with bound tsa
关键词 keywords	;TRANSFERASE-ISOMERASE COMPLEX, AROMATIC AMINO ACID BIOSYNTHESIS, MULTI-ENZYME COMPLEX, PROTEIN-PROTEIN INTERACTIONS, SHIKIMATE PATHWAY ;; TRANSFERASE/ISOMERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2w1a__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2w1a__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2w1a__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	42.15 Å
Rg（电子密度）	41.40 Å
总 Rg	41.81 Å
原子数	16464
残基数	2114
排除体积	291650 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2w1a__assembly_1__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	3-DEOXY-D-ARABINO-HEPTULOSONATE 7-PHOSPHATE SYNTHASE AROG
分子量 formula_weight	51891.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.5.1.54
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	8446

MHHHHHHSSGMNWTVDIPIDQLPSLPPLPTDLRTRLDAALAKPAAQQPTWPADQALAMRTVLESVPPVTVPSEIVRLQEQLAQVAKGEAFLLQGGDCAETFMDNTEPHIRGNVRALLQMAVVLTYGASMPVVKVARIAGQYAKPRSADIDALGLRSYRGDMINGFAPDAAAREHDPSRLVRAYANASAAMNLVRALTSSGLASLHLVHDWNREFVRTSPAGARYEALATEIDRGLRFMSACGVADRNLQTAEIYASHEALVLDYERAMLRLSDGDDGEPQLFDLSAHTVWIGERTRQIDGAHIAFAQVIANPVGVKLGPNMTPELAVEYVERLDPHNKPGRLTLVSRMGNHKVRDLLPPIVEKVQATGHQVIWQCDPMHGNTHESSTGFKTRHFDRIVDEVQGFFEVHRALGTHPGGIHVEITGENVTECLGGAQDISETDLAGRYETACDPRLNTQQSLELAFLVAEMLRD

来源 Source

来源生物 organism	MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83332
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	CHORISMATE MUTASE
分子量 formula_weight	10107.8 kDa
EC 编号 ec_number	5.4.99.5
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

MNLEMLESQPVPEIDTLREEIDRLDAEILALVKRRAEVSKAIGKARMASGGTRLVHSREMKVIERYSELGPDGKDLAILLLRLGRGRLGH

来源 Source

来源生物 organism	MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83332
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	MANGANESE (II) ION
分子量 formula_weight	54.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	O-DODECANYL OCTAETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	538.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	TETRAETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	194.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	8-HYDROXY-2-OXA-BICYCLO[3.3.1]NON-6-ENE-3,5-DICARBOXYLIC ACID
分子量 formula_weight	228.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 9 Entity 9 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	214

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d2w1aa_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.10 — Aldolase
家族 Family family	c.1.10.8 — Class-II DAHP synthetase

结构域编号 domain_id	d2w1ab_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.10 — Aldolase
家族 Family family	c.1.10.8 — Class-II DAHP synthetase

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	2w1aB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

结构域编号 domain_id	2w1aC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	59 — Chorismate Mutase Domain, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chorismate mutase

结构域编号 domain_id	2w1aD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	59 — Chorismate Mutase Domain, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chorismate mutase

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晶胞边长 a length_a	205.910 Å
晶胞边长 b length_b	205.910 Å
晶胞边长 c length_c	67.240 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 32 2 1
空间群编号 int_tables_number	154
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.350 Å
最低分辨率 resolution_low	39.840 Å
R 因子 r_factor	0.1925
R_work r_work	0.1906
R_free r_free	0.2292

Non-covalent complex between dahp synthase and chorismate mutase from Mycobacterium tuberculosis with bound tsa

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

3-DEOXY-D-ARABINO-HEPTULOSONATE 7-PHOSPHATE SYNTHASE AROG

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

CHORISMATE MUTASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2w1a__assembly_1__model_1

2w1a__assembly_1__model_1 | I(q)

2w1a__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)

Non-covalent complex between dahp synthase and chorismate mutase from Mycobacterium tuberculosis with bound tsa

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

3-DEOXY-D-ARABINO-HEPTULOSONATE 7-PHOSPHATE SYNTHASE AROG

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

CHORISMATE MUTASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2w1a__assembly_1__model_1

2w1a__assembly_1__model_1 | I(q)

2w1a__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)