← 返回搜索
2w2h

Structural basis of transcription activation by the Cyclin T1-Tat-TAR RNA complex from EIAV

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CYCLIN-T1

EQUUS CABALLUS

UniProt Q9XT26

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 2 RNA 1 PROTEIN TAT × 1 （P20920） ;5'-R(*GP*CP*UP*CP*AP*GP*AP*UP*CP*UP *GP*CP*GP*GP*UP*CP*UP*GP*AP*GP*C)-3' ; × 1 MANGANESE (II) ION × 2 water × 1 与全部聚合物一致
2 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 2 RNA 1 PROTEIN TAT × 1 （P20920） ;5'-R(*GP*CP*UP*CP*AP*GP*AP*UP*CP*UP *GP*CP*GP*GP*UP*CP*UP*GP*AP*GP*C)-3' ; × 1 water × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
2w2h 2w2h

共 2 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CCNT1_HORSE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 2–264； UniProt 5–267 作者链 B； PDB构建体 2–264； UniProt 5–267

PROTEIN TAT

EQUINE INFECTIOUS ANEMIA VIRUS

UniProt P20920

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 2 RNA 1 CYCLIN-T1 × 1 （Q9XT26） ;5'-R(*GP*CP*UP*CP*AP*GP*AP*UP*CP*UP *GP*CP*GP*GP*UP*CP*UP*GP*AP*GP*C)-3' ; × 1 MANGANESE (II) ION × 2 water × 1 与全部聚合物一致
2 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 2 RNA 1 CYCLIN-T1 × 1 （Q9XT26） ;5'-R(*GP*CP*UP*CP*AP*GP*AP*UP*CP*UP *GP*CP*GP*GP*UP*CP*UP*GP*AP*GP*C)-3' ; × 1 water × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
2w2h 2w2h

共 2 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TAT_EIAVY
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–29； UniProt 47–75 作者链 D； PDB构建体 1–29； UniProt 47–75

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2w2h
沉积日期 deposition_date2008-10-30
结构标题 titleStructural basis of transcription activation by the Cyclin T1-Tat-TAR RNA complex from EIAV
关键词 keywords;RNA-BINDING PROTEIN, TAR, TAT, CYCLIN, NUCLEUS, ACTIVATOR, CYCLIN T1, HOST-VIRUS INTERACTION, TRANSCRIPTION REGULATION, CELL CYCLE, RNA-BINDING, ACETYLATION, COILED COIL, TRANSCRIPTION, CELL DIVISION, CRYSTALLIZATION, RNA BINDING PROTEIN ;; RNA BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2w2h__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2w2h__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2w2h__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）23.47 Å
Rg（电子密度）22.20 Å
总 Rg23.10 Å
原子数2782
残基数311
排除体积47866 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2w2h__assembly_1__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2w2h__assembly_2__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id2w2hA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology472 — Cyclin A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cyclin-like
结构域编号 domain_id2w2hA02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology472 — Cyclin A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cyclin-like
结构域编号 domain_id2w2hB01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology472 — Cyclin A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cyclin-like
结构域编号 domain_id2w2hB02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology472 — Cyclin A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cyclin-like
▶

7. 引用文献 (1)