SAXSdb — 2w2x

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RAS-RELATED C3 BOTULINUM TOXIN SUBSTRATE 2

HOMO SAPIENS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	1-PHOSPHATIDYLINOSITOL-4,5-BISPHOSPHATE PHOSPHODIESTERASE GAMMA-2 × 1 （P16885） 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	1-PHOSPHATIDYLINOSITOL-4,5-BISPHOSPHATE PHOSPHODIESTERASE GAMMA-2 × 1 （P16885） 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RAC2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 8–185； UniProt 2–179 作者链 B； PDB构建体 8–185； UniProt 2–179

1-PHOSPHATIDYLINOSITOL-4,5-BISPHOSPHATE PHOSPHODIESTERASE GAMMA-2

HOMO SAPIENS

UniProt P16885

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	RAS-RELATED C3 BOTULINUM TOXIN SUBSTRATE 2 × 1 （P15153） 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	RAS-RELATED C3 BOTULINUM TOXIN SUBSTRATE 2 × 1 （P15153） 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PLCG2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2, 3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 8–51； UniProt 471–514 作者链 C； PDB构建体 52–124； UniProt 841–913 作者链 D； PDB构建体 8–51； UniProt 471–514 作者链 D； PDB构建体 52–124； UniProt 841–913

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2w2x
沉积日期 deposition_date	2008-11-04
结构标题 title	Complex of Rac2 and PLCg2 spPH Domain
关键词 keywords	;HYDROLASE, PHOSPHOLIPASE C, PHOSPHOINOSITIDES, RHO GTPASES, RAC, SH2 DOMAIN, SH3 DOMAIN, SIGNALING PROTEIN/HYDROLASE, SIGNALING PROTEIN-HYDROLASE complex ;; SIGNALING PROTEIN/HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2w2x__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2w2x__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2w2x__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	22.50 Å
Rg（电子密度）	21.59 Å
总 Rg	22.32 Å
原子数	2200
残基数	282
排除体积	39089 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2w2x__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2w2x__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	RAS-RELATED C3 BOTULINUM TOXIN SUBSTRATE 2
分子量 formula_weight	20310.3 kDa
突变 mutation	YES
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	4380

GGGSGGSQAIKCVVVGDVAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLAPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCP

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	SPODOPTERA FRUGIPERDA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	1-PHOSPHATIDYLINOSITOL-4,5-BISPHOSPHATE PHOSPHODIESTERASE GAMMA-2
分子量 formula_weight	14230.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.4.11
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

GGGSGGSKKDEHKQQGELYMWDSIDQKWTRHFCAIADAKLSFSDDIEQTMEEDNPLGSLCRGILDLNTYNVVKAPQGKNQKSFVFILEPKQQGDPPVEFATDRVEELFEWFQSIREITWKIDTK

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	SPODOPTERA FRUGIPERDA

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	1-PHOSPHATIDYLINOSITOL-4,5-BISPHOSPHATE PHOSPHODIESTERASE GAMMA-2
分子量 formula_weight	14202.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.4.11
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

GGGSGGSKKDEHKQQGELYMWDSIDQKWTRHFCAIADAKLSFSDDIEQTMEEDNPLGSLCRGILDLNTYNVVKAPQGKNQKSFVFILEPKQQGDPPVEFATDKVEELFEWFQSIREITWKIDTK

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	SPODOPTERA FRUGIPERDA

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE
分子量 formula_weight	539.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	37

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d2w2xa_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.8 — G proteins

结构域编号 domain_id	d2w2xb_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.8 — G proteins

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	2w2xA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	2w2xB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	2w2xC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)

结构域编号 domain_id	2w2xD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)

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晶胞边长 a length_a	131.570 Å
晶胞边长 b length_b	84.459 Å
晶胞边长 c length_c	74.196 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	112.21 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.300 Å
最低分辨率 resolution_low	69.406 Å
R 因子 r_factor	0.2370
R_work r_work	0.2340
R_free r_free	0.2944

Complex of Rac2 and PLCg2 spPH Domain

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RAS-RELATED C3 BOTULINUM TOXIN SUBSTRATE 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

1-PHOSPHATIDYLINOSITOL-4,5-BISPHOSPHATE PHOSPHODIESTERASE GAMMA-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2w2x__assembly_1__model_1

2w2x__assembly_1__model_1 | I(q)

2w2x__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

Complex of Rac2 and PLCg2 spPH Domain

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RAS-RELATED C3 BOTULINUM TOXIN SUBSTRATE 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

1-PHOSPHATIDYLINOSITOL-4,5-BISPHOSPHATE PHOSPHODIESTERASE GAMMA-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2w2x__assembly_1__model_1

2w2x__assembly_1__model_1 | I(q)

2w2x__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)