SAXSdb — 2w6u

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FERRIPYOVERDINE RECEPTOR

PSEUDOMONAS AERUGINOSA

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	3,6,9,12,15-PENTAOXATRICOSAN-1-OL × 2 PHOSPHATE ION × 6	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	PYOVERDIN G173 × 1 PHOSPHATE ION × 4 (1S)-1-CARBOXY-5-[(3-CARBOXYPROPANOYL)AMINO]-8,9-DIHYDROXY-1,2,3,4-TETRAHYDROPYRIMIDO[1,2-A]QUINOLIN-11-IUM × 1 FE (III) ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FPVA_PSEAE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–772； UniProt 44–815 作者链 B； PDB构建体 1–772； UniProt 44–815

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2w6u
沉积日期 deposition_date	2008-12-19
结构标题 title	Structures of P. aeruginosa FpvA bound to heterologous pyoverdines: FpvA-Pvd(G173)-Fe complex
关键词 keywords	;MEMBRANE PROTEIN, MEMBRANE, RECEPTOR, TONB BOX, SIDEROPHORE, CELL MEMBRANE, ION TRANSPORT, IRON TRANSPORT, CELL OUTER MEMBRANE, TONB-DEPENDENT TONB-DEPENDENT TRANSPORTER ;; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2w6u__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2w6u__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2w6u__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	28.52 Å
Rg（电子密度）	28.06 Å
总 Rg	28.74 Å
原子数	6098
残基数	756
排除体积	106580 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2w6u__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2w6u__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	FERRIPYOVERDINE RECEPTOR
分子量 formula_weight	86556.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	12314

QEVEFDIPPQALGSALQEFGRQADIQVLYRPEEVRNKRSSAIKGKLEPNQAITELLRGTGASVDFQGNAITISVAEAADSSVDLGATMITSNQLGTITEDSGSYTPGTIATATRLVLTPRETPQSITVVTRQNMDDFGLNNIDDVMRHTPGITVSAYDTDRNNYYARGFSINNFQYDGIPSTARNVGYSAGNTLSDMAIYDRVEVLKGATGLLTGAGSLGATINLIRKKPTHEFKGHVELGAGSWDNYRSELDVSGPLTESGNVRGRAVAAYQDKHSFMDHYERKTSVYYGILEFDLNPDTMLTVGADYQDNDPKGSGWSGSFPLFDSQGNRNDVSRSFNNGAKWSSWEQYTRTVFANLEHNFANGWVGKVQLDHKINGYHAPLGAIMGDWPAPDNSAKIVAQKYTGETKSNSLDIYLTGPFQFLGREHELVVGTSASFSHWEGKSYWNLRNYDNTTDDFINWDGDIGKPDWGTPSQYIDDKTRQLGSYMTARFNVTDDLNLFLGGRVVDYRVTGLNPTIRESGRFIPYVGAVYDLNDTYSVYASYTDIFMPQDSWYRDSSNKLLEPDEGQNYEIGIKGEYLDGRLNTSLAYFEIHEENRAEEDALYNSKPTNPAITYAYKGIKAKTKGYEAEISGELAPGWQVQAGYTHKIIRDDSGKKVSTWEPQDQLSLYTSYKFKGALDKLTVGGGARWQGKSWQMVYNNPRSRWEKFSQEDYWLVDLMARYQITDKLSASVNVNNVFDKTYYTNIGFYTSASYGDPRNLMFSTRWDF

来源 Source

来源生物 organism	PSEUDOMONAS AERUGINOSA
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	208964
宿主生物 host_organism	PSEUDOMONAS AERUGINOSA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	PYOVERDIN G173
分子量 formula_weight	836.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

SAAADAS

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	3,6,9,12,15-PENTAOXATRICOSAN-1-OL
分子量 formula_weight	350.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	PHOSPHATE ION
分子量 formula_weight	95.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	(1S)-1-CARBOXY-5-[(3-CARBOXYPROPANOYL)AMINO]-8,9-DIHYDROXY-1,2,3,4-TETRAHYDROPYRIMIDO[1,2-A]QUINOLIN-11-IUM
分子量 formula_weight	376.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	FE (III) ION
分子量 formula_weight	55.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	2w6uA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	55 — 3-Layer(bab) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Phage tail protein beta-alpha-beta fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	2w6uA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology	130 — Ferric Hydroxamate Uptake Protein; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — TonB-dependent receptor, plug domain

结构域编号 domain_id	2w6uA03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	170 — Maltoporin; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — TonB-dependent receptor, beta-barrel domain

结构域编号 domain_id	2w6uB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	55 — 3-Layer(bab) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Phage tail protein beta-alpha-beta fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	2w6uB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology	130 — Ferric Hydroxamate Uptake Protein; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — TonB-dependent receptor, plug domain

结构域编号 domain_id	2w6uB03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	170 — Maltoporin; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — TonB-dependent receptor, beta-barrel domain

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晶胞边长 a length_a	194.774 Å
晶胞边长 b length_b	129.928 Å
晶胞边长 c length_c	141.565 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	130.36 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	97.590 Å
R 因子 r_factor	0.2120
R_work r_work	0.2090
R_free r_free	0.2660

Structures of P. aeruginosa FpvA bound to heterologous pyoverdines: FpvA-Pvd(G173)-Fe complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FERRIPYOVERDINE RECEPTOR

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2w6u__assembly_2__model_1

2w6u__assembly_2__model_1 | I(q)

2w6u__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)

Structures of P. aeruginosa FpvA bound to heterologous pyoverdines: FpvA-Pvd(G173)-Fe complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FERRIPYOVERDINE RECEPTOR

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2w6u__assembly_2__model_1

2w6u__assembly_2__model_1 | I(q)

2w6u__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)