2wb0

2.1 resolution structure of the C-terminal domain of the human adenovirus 5 ssDNA binding protein

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

E2A DNA-BINDING PROTEIN

HUMAN ADENOVIRUS 5

UniProt Q2KS06

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 ZINC ION × 2 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DNB2_ADE05
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 X; PDB构建体 1–356; UniProt 174–529

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2wb0
沉积日期 deposition_date2009-02-19
结构标题 title2.1 resolution structure of the C-terminal domain of the human adenovirus 5 ssDNA binding protein
关键词 keywordsDNA-BINDING PROTEIN, SSDNA BINDING PROTEIN, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2wb0__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2wb0__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2wb0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)23.11 Å
Rg(电子密度)22.39 Å
总 Rg22.86 Å
原子数2473
残基数314
排除体积44008 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2wb0__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd2wb0x1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.54 — Domain of early E2A DNA-binding protein, ADDBP
超家族 Superfamily superfamilya.54.1 — Domain of early E2A DNA-binding protein, ADDBP
家族 Family familya.54.1.1 — Domain of early E2A DNA-binding protein, ADDBP
结构域编号 domain_idd2wb0x2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.51 — Zn-binding domains of ADDBP
超家族 Superfamily superfamilyg.51.1 — Zn-binding domains of ADDBP
家族 Family familyg.51.1.1 — Zn-binding domains of ADDBP
结构域编号 domain_idd2wb0x3
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.51 — Zn-binding domains of ADDBP
超家族 Superfamily superfamilyg.51.1 — Zn-binding domains of ADDBP
家族 Family familyg.51.1.1 — Zn-binding domains of ADDBP

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id2wb0X01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology269 — Adenovirus Single-stranded Dna-binding Protein, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Adenovirus DNA-binding, N-terminal domain
结构域编号 domain_id2wb0X02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology148 — Adenovirus Single-stranded DNA-binding Protein; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Adenovirus DNA-binding, C-terminal domain superfamily/Adenovirus DNA-binding, zinc binding domain
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7. 引用文献 (1)