物种未注明
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | alpha-D-mannopyranose × 4 SULFATE ION × 2 METHYL (2S)-[1-((N-FORMYL)-L-VALYL)AMINO-2-(2-NAPHTHYL)ETHYL)HYDROXYPHOSPHINYLOXY]-3-PHENYL PROPANOATE × 2 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | PENP_PENJA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–323； UniProt 1–323 |
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| 条目编号 entry_id | 2web |
| 沉积日期 deposition_date | 1998-02-03 |
| 结构标题 title | ACID PROTEINASE (PENICILLOPEPSIN) (E.C.3.4.23.20) COMPLEX WITH PHOSPHONATE INHIBITOR: METHYL(2S)-[1-(((N-FORMYL)-L-VALYL)AMINO-2-(2-NAPHTHYL)ETHYL)HYDROXYPHOSPHINYLOXY]-3-PHENYLPROPANOATE, SODIUM SALT |
| 关键词 keywords | PENICILLOPEPSIN, PHOSPHONATE INHIBITOR, HYDROLASE; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 27.85 Å |
| Rg（电子密度） | 26.82 Å |
| 总 Rg | 27.67 Å |
| 原子数 | 4862 |
| 残基数 | 646 |
| 排除体积 | 84788 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2weba_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.50 — Acid proteases |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.50.1 — Acid proteases |
| 家族 Family family | b.50.1.2 — Pepsin-like |
| 结构域编号 domain_id | 2webA01 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Acid Proteases |
| 结构域编号 domain_id | 2webA02 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Acid Proteases |