SAXSdb — 2wg3

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DESERT HEDGEHOG PROTEIN N-PRODUCT

HOMO SAPIENS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	HEDGEHOG-INTERACTING PROTEIN × 1 （Q96QV1） ZINC ION × 1 CHLORIDE ION × 3 PHOSPHATE ION × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	HEDGEHOG-INTERACTING PROTEIN × 1 （Q96QV1） ZINC ION × 1 CHLORIDE ION × 3 PHOSPHATE ION × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DHH_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–156； UniProt 40–194 作者链 B； PDB构建体 2–156； UniProt 40–194

HEDGEHOG-INTERACTING PROTEIN

HOMO SAPIENS

UniProt Q96QV1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	DESERT HEDGEHOG PROTEIN N-PRODUCT × 1 （O43323） ZINC ION × 1 CHLORIDE ION × 3 PHOSPHATE ION × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	DESERT HEDGEHOG PROTEIN N-PRODUCT × 1 （O43323） ZINC ION × 1 CHLORIDE ION × 3 PHOSPHATE ION × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HHIP_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–457； UniProt 214–670 作者链 D； PDB构建体 1–457； UniProt 214–670

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2wg3
沉积日期 deposition_date	2009-04-15
结构标题 title	Crystal structure of the complex between human hedgehog-interacting protein HIP and desert hedgehog without calcium
关键词 keywords	;LIPOPROTEIN, DEVELOPMENT, MEMBRANE, SECRETED, PROTEASE, PALMITATE, HYDROLASE, DEVELOPMENTAL PROTEIN, AUTOCATALYTIC CLEAVAGE, SIGNAL TRANSDUCTION, EGF-LIKE DOMAIN, DISEASE MUTATION, HEDGEHOG SIGNALING, GLYCOPROTEIN, CELL MEMBRANE, DISULFIDE BOND, SIGNALING PROTEIN ;; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2wg3__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2wg3__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2wg3__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	27.72 Å
Rg（电子密度）	26.81 Å
总 Rg	27.66 Å
原子数	4413
残基数	559
排除体积	77956 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2wg3__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2wg3__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	DESERT HEDGEHOG PROTEIN N-PRODUCT
分子量 formula_weight	18662.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	8980

ALVPLLYKQFVPGVPERTLGASGPAEGRVARGSERFRDLVPNYNPDIIFKDEENSGADRLMTERCKERVNALAIAVMNMWPGVRLRVTEGWDEDGHHAQDSLHYEGRALDITTSDRDRNKYGLLARLAVEAGFDWVYYESRNHVHVSVKADNSLAVLEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	HEDGEHOG-INTERACTING PROTEIN
分子量 formula_weight	51800.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

HNCFCIQEVVSGLRQPVGALHSGDGSQRLFILEKEGYVKILTPEGEIFKEPYLDIHKLVQSGIKGGDERGLLSLAFHPNYKKNGKLYVSYTTNQERWAIGPHDHILRVVEYTVSRKNPHQVDLRTARVFLEVAELHRKHLGGQLLFGPDGFLYIILGDGMITLDDMEEMDGLSDFTGSVLRLDVDTDMCNVPYSIPRSNPHFNSTNQPPEVFAHGLHDPGRCAVDRHPTDININLTILCSDSNGKNRSSARILQIIKGKDYESEPSLLEFKPFSNGPLVGGFVYRGCQSERLYGSYVFGDRNGNFLTLQQSPVTKQWQEKPLCLGTSGSCRGYFSGHILGFGEDELGEVYILSSSKSMTQTHNGKLYKIVDPKRPLMPEECRATVQPAQTLTSECSRLCRNGYCTPTGKCCCSPGWEGDFCRTAKCEPACRHGGVCVRPNKCLCKKGYLGPQCEQVDHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	HOMO SAPIENS

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	PHOSPHATE ION
分子量 formula_weight	95.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	123

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d2wg3a1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.65 — Hedgehog/DD-peptidase
超家族 Superfamily superfamily	d.65.1 — Hedgehog/DD-peptidase
家族 Family family	d.65.1.2 — Hedgehog (development protein), N-terminal signaling domain

结构域编号 domain_id	d2wg3a2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2wg3a3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2wg3b_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.65 — Hedgehog/DD-peptidase
超家族 Superfamily superfamily	d.65.1 — Hedgehog/DD-peptidase
家族 Family family	d.65.1.2 — Hedgehog (development protein), N-terminal signaling domain

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	2wg3A00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1380 — Muramoyl-pentapeptide Carboxypeptidase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2wg3B00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1380 — Muramoyl-pentapeptide Carboxypeptidase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2wg3C02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	25 — Laminin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Laminin

结构域编号 domain_id	2wg3D02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	25 — Laminin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Laminin

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晶胞边长 a length_a	102.821 Å
晶胞边长 b length_b	110.701 Å
晶胞边长 c length_c	144.381 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.600 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.2270
R_work r_work	0.2240
R_free r_free	0.2810

Crystal structure of the complex between human hedgehog-interacting protein HIP and desert hedgehog without calcium

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DESERT HEDGEHOG PROTEIN N-PRODUCT

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

HEDGEHOG-INTERACTING PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2wg3__assembly_2__model_1

2wg3__assembly_2__model_1 | I(q)

2wg3__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the complex between human hedgehog-interacting protein HIP and desert hedgehog without calcium

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DESERT HEDGEHOG PROTEIN N-PRODUCT

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

HEDGEHOG-INTERACTING PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2wg3__assembly_2__model_1

2wg3__assembly_2__model_1 | I(q)

2wg3__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)