HELICOBACTER PYLORI
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 12 | (4R,6R,7S)-2-(2-CYCLOPROPYLETHYL)-4,6,7-TRIHYDROXY-4,5,6,7-TETRAHYDRO-1-BENZOTHIOPHENE-4-CARBOXYLIC ACID × 12 water × 12 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | AROQ_HELPY |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–167； UniProt 1–167 |
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| 条目编号 entry_id | 2xda |
| 沉积日期 deposition_date | 2010-04-30 |
| 结构标题 title | STRUCTURE OF HELICOBACTER PYLORI TYPE II DEHYDROQUINASE IN COMPLEX WITH INHIBITOR COMPOUND (4R,6R,7S)-2-(2-Cyclopropyl)ethyl-4,6,7- trihydroxy-4,5,6,7-tetrahydrobenzo(b)thiophene-4-carboxylic acid |
| 关键词 keywords | AROMATIC AMINO ACID BIOSYNTHESIS, LYASE; LYASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 36.81 Å |
| Rg（电子密度） | 35.92 Å |
| 总 Rg | 36.58 Å |
| 原子数 | 14076 |
| 残基数 | 1800 |
| 排除体积 | 253490 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2xdaa_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.23 — Flavodoxin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.23.13 — Type II 3-dehydroquinate dehydratase |
| 家族 Family family | c.23.13.1 — Type II 3-dehydroquinate dehydratase |
| 结构域编号 domain_id | 2xdaA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 9100 — Dehydroquinase, class II |