2xg8

Structural basis of gene regulation by protein PII: The crystal complex of PII and PipX from Synechococcus elongatus PCC 7942

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NITROGEN REGULATORY PROTEIN P-II

SYNECHOCOCCUS ELONGATUS

UniProt P0A3F4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 12 PIPX × 6 (Q7X386) water × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GLNB_SYNE7
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–112; UniProt 1–112 作者链 B; PDB构建体 1–112; UniProt 1–112 作者链 C; PDB构建体 1–112; UniProt 1–112

PIPX

SYNECHOCOCCUS ELONGATUS

UniProt Q7X386

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 12 NITROGEN REGULATORY PROTEIN P-II × 6 (P0A3F4) water × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q7X386_SYNE7
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 2–89; UniProt 1–89 作者链 E; PDB构建体 2–89; UniProt 1–89 作者链 F; PDB构建体 2–89; UniProt 1–89

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2xg8
沉积日期 deposition_date2010-06-01
结构标题 titleStructural basis of gene regulation by protein PII: The crystal complex of PII and PipX from Synechococcus elongatus PCC 7942
关键词 keywordsTRANSCRIPTION, PII SIGNALING PROTEIN, NTCA CO-ACTIVATOR PROTEIN PIPX, TUDOR-LIKE DOMAIN; TRANSCRIPTION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2xg8__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2xg8__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2xg8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)44.49 Å
Rg(电子密度)44.37 Å
总 Rg44.66 Å
原子数9058
残基数1156
排除体积161880 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2xg8__assembly_1__model_1 dodecameric (12) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

CATH v4.4 (7 domains)

结构域编号 domain_id2xg8A00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily120 —
结构域编号 domain_id2xg8B00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily120 —
结构域编号 domain_id2xg8C00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily120 —
结构域编号 domain_id2xg8D01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily660 — Protein of unknown function (DUF3539)
结构域编号 domain_id2xg8D02
类 Class class6 — Special
架构 Architecture architecture10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology250 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily870 —
结构域编号 domain_id2xg8E01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily660 — Protein of unknown function (DUF3539)
结构域编号 domain_id2xg8E02
类 Class class6 — Special
架构 Architecture architecture10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology250 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily870 —
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7. 引用文献 (1)