ESCHERICHIA COLI
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | DNA POLYMERASE III SUBUNIT THETA × 1 （P0ABT0） CALCIUM ION × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | DPO3E_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–186； UniProt 1–186 |
ESCHERICHIA COLI
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | DNA POLYMERASE III SUBUNIT EPSILON × 1 （P03007） CALCIUM ION × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | HOLE_ECO57 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
| 条目编号 entry_id | 2xy8 |
| 沉积日期 deposition_date | 2010-11-16 |
| 结构标题 title | Paramagnetic-based NMR structure of the complex between the N- terminal epsilon domain and the theta domain of the DNA polymerase III |
| 关键词 keywords | TRANSFERASE, DOCKING, EXPERIMENTAL RESTRAINTS, HADDOCK PROGRAM; TRANSFERASE |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
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Assembly 1 · Model 5 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 19.44 Å |
| Rg（电子密度） | 18.32 Å |
| 总 Rg | 19.33 Å |
| 原子数 | 2291 |
| 残基数 | 236 |
| 排除体积 | 33316 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 2xy8__assembly_1__model_1 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 2xy8__assembly_1__model_2 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 2xy8__assembly_1__model_3 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 2xy8__assembly_1__model_4 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 5 | 2xy8__assembly_1__model_5 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 6 | 2xy8__assembly_1__model_6 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 7 | 2xy8__assembly_1__model_7 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 8 | 2xy8__assembly_1__model_8 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 9 | 2xy8__assembly_1__model_9 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 10 | 2xy8__assembly_1__model_10 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 结构域编号 domain_id | d2xy8a_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.55 — Ribonuclease H-like motif |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.55.3 — Ribonuclease H-like |
| 家族 Family family | c.55.3.5 — DnaQ-like 3'-5' exonuclease |
| 结构域编号 domain_id | d2xy8b_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.237 — DNA polymerase III theta subunit-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.237.1 — DNA polymerase III theta subunit-like |
| 家族 Family family | a.237.1.1 — DNA polymerase III theta subunit-like |
| 结构域编号 domain_id | 2xy8A00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 420 — Nucleotidyltransferase; domain 5 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H |
| 结构域编号 domain_id | 2xy8B00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 250 — DNA polymerase III-theta |