SAXSdb — 2xz1

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ACYL-[ACYL-CARRIER-PROTEIN] DESATURASE, CHLOROPLASTIC

RICINUS COMMUNIS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	ACYL CARRIER PROTEIN 1, CHLOROPLASTIC × 2 （P07854） FE (III) ION × 4 CALCIUM ION × 2 CACODYLATE ION × 2 (2R)-2,4-dihydroxy-3,3-dimethyl-N-{3-oxo-3-[(2-sulfanylethyl)amino]propyl}butanamide × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	STAD_RICCO
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–363； UniProt 34–396 作者链 B； PDB构建体 1–363； UniProt 34–396

ACYL CARRIER PROTEIN 1, CHLOROPLASTIC

SPINACIA OLERACEA

UniProt P07854

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	ACYL-[ACYL-CARRIER-PROTEIN] DESATURASE, CHLOROPLASTIC × 2 （P22337） FE (III) ION × 4 CALCIUM ION × 2 CACODYLATE ION × 2 (2R)-2,4-dihydroxy-3,3-dimethyl-N-{3-oxo-3-[(2-sulfanylethyl)amino]propyl}butanamide × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACP1_SPIOL
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–82； UniProt 57–138 作者链 D； PDB构建体 1–82； UniProt 57–138

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2xz1
沉积日期 deposition_date	2010-11-22
结构标题 title	The Structure of the 2:2 (Fully Occupied) Complex Between Stearoyl Acyl Carrier Protein Desaturase from Ricinus Communis (Castor Bean) and Acyl Carrier Protein.
关键词 keywords	OXIDOREDUCTASE-LIPID BINDING PROTEIN COMPLEX; OXIDOREDUCTASE/LIPID BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2xz1__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2xz1__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2xz1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	32.01 Å
Rg（电子密度）	31.93 Å
总 Rg	32.42 Å
原子数	6948
残基数	863
排除体积	123540 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2xz1__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ACYL-[ACYL-CARRIER-PROTEIN] DESATURASE, CHLOROPLASTIC
分子量 formula_weight	41703.3 kDa
EC 编号 ec_number	1.14.19.2
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	6948

ASTLKSGSKEVENLKKPFMPPREVHVQVTHSMPPQKIEIFKSLDNWAEENILVHLKPVEKCWQPQDFLPDPASDGFDEQVRELRERAKEIPDDYFVVLVGDMITEEALPTYQTMLNTLDGVRDETGASPTSWAIWTRAWTAEENRHGDLLNKYLYLSGRVDMRQIEKTIQYLIGSGMDPRTENSPYLGFIYTSFQERATFISHGNTARQAKEHGDIKLAQICGTIAADEKRHETAYTKIVEKLFEIDPDGTVLAFADMMRKKISMPAHLMYDGRDDNLFDHFSAVAQRLGVYTAKDYADILEFLVGRWKVDKLTGLSAEGQKAQDYVCRLPPRIRRLEERAQGRAKEAPTMPFSWIFDRQVKL

来源 Source

来源生物 organism	RICINUS COMMUNIS
通用名 common_name	CASTOR BEAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3988
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ACYL CARRIER PROTEIN 1, CHLOROPLASTIC
分子量 formula_weight	8924.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

AKKETIDKVSDIVKEKLALGADVVVTADSEFSKLGADSLDTVEIVMNLEEEFGINVDEDKAQDISTIQQAADVIEGLLEKKA

来源 Source

来源生物 organism	SPINACIA OLERACEA
通用名 common_name	SPINACH
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3562
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	FE (III) ION
分子量 formula_weight	55.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	CACODYLATE ION
分子量 formula_weight	137.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	(2R)-2,4-dihydroxy-3,3-dimethyl-N-{3-oxo-3-[(2-sulfanylethyl)amino]propyl}butanamide
分子量 formula_weight	278.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	2xz1A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	620 — Ribonucleotide Reductase, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Ribonucleotide Reductase, subunit A

结构域编号 domain_id	2xz1B00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	620 — Ribonucleotide Reductase, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Ribonucleotide Reductase, subunit A

结构域编号 domain_id	2xz1C00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1200 — Non-ribosomal Peptide Synthetase Peptidyl Carrier Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ACP-like

结构域编号 domain_id	2xz1D00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1200 — Non-ribosomal Peptide Synthetase Peptidyl Carrier Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ACP-like

▶

晶胞边长 a length_a	76.404 Å
晶胞边长 b length_b	76.404 Å
晶胞边长 c length_c	403.372 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 43 2 2
空间群编号 int_tables_number	95
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.350 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.2115
R_work r_work	0.2093
R_free r_free	0.2545

The Structure of the 2:2 (Fully Occupied) Complex Between Stearoyl Acyl Carrier Protein Desaturase from Ricinus Communis (Castor Bean) and Acyl Carrier Protein.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ACYL-[ACYL-CARRIER-PROTEIN] DESATURASE, CHLOROPLASTIC

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ACYL CARRIER PROTEIN 1, CHLOROPLASTIC

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2xz1__assembly_1__model_1

2xz1__assembly_1__model_1 | I(q)

2xz1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

The Structure of the 2:2 (Fully Occupied) Complex Between Stearoyl Acyl Carrier Protein Desaturase from Ricinus Communis (Castor Bean) and Acyl Carrier Protein.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ACYL-[ACYL-CARRIER-PROTEIN] DESATURASE, CHLOROPLASTIC

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ACYL CARRIER PROTEIN 1, CHLOROPLASTIC

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2xz1__assembly_1__model_1

2xz1__assembly_1__model_1 | I(q)

2xz1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)