SACCHAROPHAGUS DEGRADANS
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | CALCIUM ION × 2 CHLORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 3 ZINC ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 3 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | Q21PD3_SACD2 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 24–437； UniProt 520–933 |
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| 条目编号 entry_id | 2yhg |
| 沉积日期 deposition_date | 2011-04-30 |
| 结构标题 title | Ab initio phasing of a nucleoside hydrolase-related hypothetical protein from Saccharophagus degradans that is associated with carbohydrate metabolism |
| 关键词 keywords | HYDROLASE, GLYCOSIDE HYDROLASE; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 22.22 Å |
| Rg（电子密度） | 21.05 Å |
| 总 Rg | 21.85 Å |
| 原子数 | 3174 |
| 残基数 | 411 |
| 排除体积 | 55402 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 2yhgA01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 90 — Alpha-Beta Complex |
| 拓扑 Topology topology | 245 — Inosine-uridine Nucleoside N-ribohydrolase; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Ribonucleoside hydrolase-like |
| 结构域编号 domain_id | 2yhgA02 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Immunoglobulin-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Immunoglobulins |