Escherichia coli
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 2 | 5'-D(*AP*CP*TP*GP*TP*CP*AP*TP*AP*AP*AP*TP*CP*TP*GP*T)-3' × 1 5'-D(*AP*CP*AP*GP*AP*TP*TP*TP*AP*TP*GP*AP*CP*AP*GP*T)-3' × 1 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | PHOB_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–104； UniProt 126–229 |
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| 条目编号 entry_id | 2z33 |
| 沉积日期 deposition_date | 2007-05-31 |
| 结构标题 title | Solution structure of the DNA complex of PhoB DNA-binding/transactivation Domain |
| 关键词 keywords | WINGED HELIX-TURN-HELIX, TRANSCRIPTION-DNA COMPLEX; TRANSCRIPTION/DNA |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
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Assembly 1 · Model 2 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 19.49 Å |
| Rg（电子密度） | 18.46 Å |
| 总 Rg | 19.32 Å |
| 原子数 | 2714 |
| 残基数 | 136 |
| 排除体积 | 24614 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 2z33__assembly_1__model_1 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 2z33__assembly_1__model_2 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 2z33__assembly_1__model_3 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 2z33__assembly_1__model_4 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 5 | 2z33__assembly_1__model_5 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 6 | 2z33__assembly_1__model_6 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 7 | 2z33__assembly_1__model_7 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 8 | 2z33__assembly_1__model_8 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 9 | 2z33__assembly_1__model_9 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 10 | 2z33__assembly_1__model_10 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 结构域编号 domain_id | d2z33a_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.4.6 — C-terminal effector domain of the bipartite response regulators |
| 家族 Family family | a.4.6.1 — PhoB-like |
| 结构域编号 domain_id | 2z33A00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 10 — Arc Repressor Mutant, subunit A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain |