← 返回搜索
2zbh

Crystal structure of the complex of phospholipase A2 with Bavachalcone from Aerva lanata at 2.6 A resolution

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 51.8 Å Quality: GOOD
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phospholipase A2 VRV-PL-VIIIa

物种未注明

UniProt P59071

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–121 未记录 BVL (2E)-1-[2-hydroxy-4-methoxy-5-(3-methylbut-2-en-1-yl)phenyl]-3-(4-hydroxyphenyl)prop-2-en-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；50mm Ammonium acetate, 0.2M ammonium sulphate, 30%PEG 4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K 分辨率 2.60 Å R-free 0.227

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 2ZBH Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1CL5 CRYSTAL STRUCTURE OF PHOSPHOLIPASE A2 FROM DABOIA RUSSELLI PULCHELLA 提交 1999-05-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–39（39 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；PROTEIN WAS CRYSTALLISED FROM 1.2 AMMONIUM SULPHATE BUFFER WITH 20MM SODIUM CACODYLATE, 2MM CALCIUM CHLORIDE AND 3% DIOXANE, pH 7.0
分辨率 2.45 Å R-free 0.267
1CL5 CRYSTAL STRUCTURE OF PHOSPHOLIPASE A2 FROM DABOIA RUSSELLI PULCHELLA 提交 1999-05-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–39（39 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；PROTEIN WAS CRYSTALLISED FROM 1.2 AMMONIUM SULPHATE BUFFER WITH 20MM SODIUM CACODYLATE, 2MM CALCIUM CHLORIDE AND 3% DIOXANE, pH 7.0
分辨率 2.45 Å R-free 0.267
1FB2 STRUCTURE OF PHOSPHOLIPASE A2 FROM DABOIA RUSSELLI PULCHELLA AT 1.95 提交 2000-07-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–50（50 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；20mM Sodium Cacodylate, 1.4M Ammonium Sulphate, 4mM Calcium Chloride, 3% Dioxane, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.95 Å R-free 0.272
1FB2 STRUCTURE OF PHOSPHOLIPASE A2 FROM DABOIA RUSSELLI PULCHELLA AT 1.95 提交 2000-07-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–50（50 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；20mM Sodium Cacodylate, 1.4M Ammonium Sulphate, 4mM Calcium Chloride, 3% Dioxane, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.95 Å R-free 0.272
1FV0 FIRST STRUCTURAL EVIDENCE OF THE INHIBITION OF PHOSPHOLIPASE A2 BY ARISTOLOCHIC ACID: CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX FORMED BETWEEN PHOSPHOLIPASE A2 AND ARISTOLOCHIC ACID 提交 2000-09-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–50（50 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 9AR 9-HYDROXY ARISTOLOCHIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；20mM Sodium cacodylate, 1.4M Ammonium sulfate, 4mM Calcium chloride, 3% dioxane, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.70 Å R-free 0.201
1FV0 FIRST STRUCTURAL EVIDENCE OF THE INHIBITION OF PHOSPHOLIPASE A2 BY ARISTOLOCHIC ACID: CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX FORMED BETWEEN PHOSPHOLIPASE A2 AND ARISTOLOCHIC ACID 提交 2000-09-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–50（50 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；20mM Sodium cacodylate, 1.4M Ammonium sulfate, 4mM Calcium chloride, 3% dioxane, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.70 Å R-free 0.201
1FV0 FIRST STRUCTURAL EVIDENCE OF THE INHIBITION OF PHOSPHOLIPASE A2 BY ARISTOLOCHIC ACID: CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX FORMED BETWEEN PHOSPHOLIPASE A2 AND ARISTOLOCHIC ACID 提交 2000-09-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–50（50 aa）
链 B 1–50（50 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 8 ACT ACETATE ION × 2 9AR 9-HYDROXY ARISTOLOCHIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 4 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；20mM Sodium cacodylate, 1.4M Ammonium sulfate, 4mM Calcium chloride, 3% dioxane, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.70 Å R-free 0.201
1JQ9 Crystal structure of a complex formed between phospholipase A2 from Daboia russelli pulchella and a designed pentapeptide Phe-Leu-Ser-Tyr-Lys at 1.8 resolution 提交 2001-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 ACY ACETIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；20mM Sodium cacodylate, 1.4M Ammonium sulfate, 4mM Calcium chloride, 3% dioxane, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
1JQ9 Crystal structure of a complex formed between phospholipase A2 from Daboia russelli pulchella and a designed pentapeptide Phe-Leu-Ser-Tyr-Lys at 1.8 resolution 提交 2001-08-04 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–121（121 aa）
未记录 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；20mM Sodium cacodylate, 1.4M Ammonium sulfate, 4mM Calcium chloride, 3% dioxane, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
1JQ9 Crystal structure of a complex formed between phospholipase A2 from Daboia russelli pulchella and a designed pentapeptide Phe-Leu-Ser-Tyr-Lys at 1.8 resolution 提交 2001-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–121（121 aa）
链 B 1–121（121 aa）
未记录 ACY ACETIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；20mM Sodium cacodylate, 1.4M Ammonium sulfate, 4mM Calcium chloride, 3% dioxane, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
1JQ9 Crystal structure of a complex formed between phospholipase A2 from Daboia russelli pulchella and a designed pentapeptide Phe-Leu-Ser-Tyr-Lys at 1.8 resolution 提交 2001-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–121（121 aa）
链 B 1–121（121 aa）
未记录 ACY ACETIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；20mM Sodium cacodylate, 1.4M Ammonium sulfate, 4mM Calcium chloride, 3% dioxane, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
1KPM First Structural Evidence of a Specific Inhibition of Phospholipase A2 by Vitamin E and its Implications in Inflammation: Crystal Structure of the Complex Formed between Phospholipase A2 and Vitamin E at 1.8 A Resolution. 提交 2002-01-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–50（50 aa）
未记录 VIT VITAMIN E × 1 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；20mM Sodium cacodylate, 1.4M Ammonium sulfate, 4mM Calcium chloride, 3% dioxane, pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.228
1KPM First Structural Evidence of a Specific Inhibition of Phospholipase A2 by Vitamin E and its Implications in Inflammation: Crystal Structure of the Complex Formed between Phospholipase A2 and Vitamin E at 1.8 A Resolution. 提交 2002-01-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–50（50 aa）
未记录 ACY ACETIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；20mM Sodium cacodylate, 1.4M Ammonium sulfate, 4mM Calcium chloride, 3% dioxane, pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.228
1OXL INHIBITION OF PHOSPHOLIPASE A2 (PLA2) BY (2-CARBAMOYLMETHYL-5-PROPYL-OCTAHYDRO-INDOL-7-YL)-ACETIC ACID (INDOLE): CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX FORMED BETWEEN PLA2 FROM RUSSELL'S VIPER AND INDOLE AT 1.8 RESOLUTION 提交 2003-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–121（121 aa）
链 B 1–121（121 aa）
未记录 IDA (2-CARBAMOYLMETHYL-5-PROPYL-OCTAHYDRO-INDOL-7-YL)ACETIC ACID × 1 CO3 CARBONATE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；1.2 Ammonium sulphate buffer with 20mm sodium cacodylate, 50mm calcium chloride, 3% dioxane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 1.80 Å R-free 0.238
1OXL INHIBITION OF PHOSPHOLIPASE A2 (PLA2) BY (2-CARBAMOYLMETHYL-5-PROPYL-OCTAHYDRO-INDOL-7-YL)-ACETIC ACID (INDOLE): CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX FORMED BETWEEN PLA2 FROM RUSSELL'S VIPER AND INDOLE AT 1.8 RESOLUTION 提交 2003-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–121（121 aa）
链 B 1–121（121 aa）
未记录 IDA (2-CARBAMOYLMETHYL-5-PROPYL-OCTAHYDRO-INDOL-7-YL)ACETIC ACID × 2 CO3 CARBONATE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；1.2 Ammonium sulphate buffer with 20mm sodium cacodylate, 50mm calcium chloride, 3% dioxane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 1.80 Å R-free 0.238
1OXL INHIBITION OF PHOSPHOLIPASE A2 (PLA2) BY (2-CARBAMOYLMETHYL-5-PROPYL-OCTAHYDRO-INDOL-7-YL)-ACETIC ACID (INDOLE): CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX FORMED BETWEEN PLA2 FROM RUSSELL'S VIPER AND INDOLE AT 1.8 RESOLUTION 提交 2003-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–121（121 aa）
链 B 1–121（121 aa）
未记录 IDA (2-CARBAMOYLMETHYL-5-PROPYL-OCTAHYDRO-INDOL-7-YL)ACETIC ACID × 1 CO3 CARBONATE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；1.2 Ammonium sulphate buffer with 20mm sodium cacodylate, 50mm calcium chloride, 3% dioxane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 1.80 Å R-free 0.238
1OXL INHIBITION OF PHOSPHOLIPASE A2 (PLA2) BY (2-CARBAMOYLMETHYL-5-PROPYL-OCTAHYDRO-INDOL-7-YL)-ACETIC ACID (INDOLE): CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX FORMED BETWEEN PLA2 FROM RUSSELL'S VIPER AND INDOLE AT 1.8 RESOLUTION 提交 2003-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–121（121 aa）
链 B 1–121（121 aa）
未记录 IDA (2-CARBAMOYLMETHYL-5-PROPYL-OCTAHYDRO-INDOL-7-YL)ACETIC ACID × 1 CO3 CARBONATE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；1.2 Ammonium sulphate buffer with 20mm sodium cacodylate, 50mm calcium chloride, 3% dioxane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 1.80 Å R-free 0.238
1OYF Crystal Structure of Russelles viper (Daboia russellii pulchella) phospholipase A2 in a complex with venom 6-methyl heptanol 提交 2003-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 MHN 6-METHYLHEPTAN-1-OL × 2 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1M Cacodylate buffer, 0.2M Ammonoum Sulphate, 15% PEG8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.45 Å R-free 0.235
1Q6V First crystal structure of a C49 monomer PLA2 from the venom of Daboia russelli pulchella at 1.8 A resolution 提交 2003-08-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa） 片段：Phospholipase A2
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；30%PEG4000, 0.2M Ammonium Sulphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.86 Å R-free 0.208
1Q7A Crystal structure of the complex formed between russell's viper phospholipase A2 and an antiinflammatory agent oxyphenbutazone at 1.6A resolution 提交 2003-08-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa） 片段：Phospholipase A2
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 OPB 4-BUTYL-1-(4-HYDROXYPHENYL)-2-PHENYLPYRAZOLIDINE-3,5-DIONE × 1 MOH METHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；30% PEG 4000, 0.2M ammonium sulphate,30% Methanol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.213
1SQZ Design of specific inhibitors of Phopholipase A2: Crystal structure of the complex formed between Group II Phopholipase A2 and a designed peptide Dehydro-Ile-Ala-Arg-Ser at 1.2A resolution 提交 2004-03-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；297 K；0.2M Ammonium sulphate,50% PEG, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
分辨率 1.20 Å R-free 0.217
1SV3 Structure of the complex formed between Phospholipase A2 and 4-methoxybenzoic acid at 1.3A resolution. 提交 2004-03-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–50（50 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 ANN 4-METHOXYBENZOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；297 K；0.2M Ammonium sulphate, 50% PEG, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
分辨率 1.35 Å R-free 0.243
1SV9 Crystal structure of the complex formed between groupII phospholipase A2 and anti-inflammatory agent 2-[(2,6-Dichlorophenyl)amino] benzeneacetic acid at 2.7A resolution 提交 2004-03-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 DIF 2-[2,6-DICHLOROPHENYL)AMINO]BENZENEACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；297 K；0.2M Ammonium sulphate, 50% PEG, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
分辨率 2.71 Å R-free 0.238
1SXK Crystal Structure of a complex formed between phospholipase A2 and a non-specific anti-inflammatory amino salicylic acid at 1.2 A resolution 提交 2004-03-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 BHA 2-HYDROXY-4-AMINOBENZOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；297 K；0.2M ammonium sulphate, 50% PEG, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
分辨率 1.21 Å R-free 0.188
1TDV Non-specific binding to phospholipase A2:Crystal structure of the complex of PLA2 with a designed peptide Tyr-Trp-Ala-Ala-Ala-Ala at 1.7A resolution 提交 2004-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.2M AMMONIUM SULPHATE, 30% PEG, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 1.70 Å R-free 0.206
1TG1 Crystal Structure of the complex formed between russells viper phospholipase A2 and a designed peptide inhibitor PHQ-Leu-Val-Arg-Tyr at 1.2A resolution 提交 2004-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 ACY ACETIC ACID × 1 MOH METHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.2M AMMONIUM SULPHATE, 30% PEG, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.25 Å R-free 0.197
1TG4 Design of specific inhibitors of groupII phospholipase A2(PLA2): Crystal structure of the complex formed between russells viper PLA2 and designed peptide Phe-Leu-Ala-Tyr-Lys at 1.7A resolution 提交 2004-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.2M AMMONIUM SULPHATE, 30% PEG, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.70 Å R-free 0.196
1TGM Crystal structure of a complex formed between group II phospholipase A2 and aspirin at 1.86 A resolution 提交 2004-05-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 AIN 2-(ACETYLOXY)BENZOIC ACID × 1 CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；Polyethylene glycol, ammonium sulphate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.86 Å R-free 0.224
1TH6 Crystal structure of phospholipase A2 in complex with atropine at 1.23A resolution 提交 2004-06-01 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 OIN (1R,5S)-8-METHYL-8-AZABICYCLO[3.2.1]OCT-3-YL (2R)-3-HYDROXY-2-PHENYLPROPANOATE × 1 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.2M ammonium sulphate, 30% PEG 4000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.23 Å R-free 0.204
1TJ9 Structure of the complexed formed between group II phospholipase A2 and a rationally designed tetra peptide,Val-Ala-Arg-Ser at 1.1A resolution 提交 2004-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.2M AMMONIUM SULPHATE, 30% PEG, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 1.10 Å R-free 0.209
1TJK Crystal structure of the complex formed between group II phospholipase A2 with a designed pentapeptide, Phe- Leu- Ser- Thr- Lys at 1.2 A resolution 提交 2004-06-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；Ammonium Sulphate, Polyethylene glycol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.25 Å R-free 0.203
1TK4 Crystal structure of russells viper phospholipase A2 in complex with a specifically designed tetrapeptide Ala-Ile-Arg-Ser at 1.1 A resolution 提交 2004-06-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.2M AMMONIUM SULPHATE, 30% PEG , pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.10 Å R-free 0.185
1TP2 Crystal structure of the complex of group II phospholipaseA2 dimer with a fatty acid tridecanoic acid at 2.4 A resolution 提交 2004-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–121（121 aa）
链 B 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 TDA N-TRIDECANOIC ACID × 2 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；293 K；20mM Sodium acetate, Calcium chloride, 15% PEG8000, 0.2M Ammonium sulphate, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.242
1Y38 Crystal structure of the complex formed between phospholipase A2 dimer and glycerophosphate at 2.4 A resolution 提交 2004-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–121（121 aa）
链 B 1–121（121 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 G3P SN-GLYCEROL-3-PHOSPHATE × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25mM Cacodylate, 0.3M ammonium sulphate, 30% PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.44 Å R-free 0.224
1ZR8 Crystal Structure of the complex formed between group II phospholipase A2 and a plant alkaloid ajmaline at 2.0A resolution 提交 2005-05-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 AJM AJMALINE × 1 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.2M AMMONIUM SULPHATE, 30% PEG, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.03 Å R-free 0.221
1ZWP The atomic resolution Crystal structure of the Phospholipase A2 (PLA2) complex with Nimesulide reveals its weaker binding to PLA2 提交 2005-06-04 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 NIM 4-NITRO-2-PHENOXYMETHANESULFONANILIDE × 1 MOH METHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.2M Ammonium sulphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.10 Å R-free 0.147
1ZYX Crystal structure of the complex of a group IIA phospholipase A2 with a synthetic anti-inflammatory agent licofelone at 1.9A resolution 提交 2005-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 LCF [6-(4-CHLOROPHENYL)-2,2-DIMETHYL-7-PHENYL-2,3-DIHYDRO-1H-PYRROLIZIN-5-YL]ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；Ammonium Sulphate, PEG4000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.95 Å R-free 0.219
2ARM Crystal Structure of the Complex of Phospholipase A2 with a natural compound atropine at 1.2 A resolution 提交 2005-08-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 OIN (1R,5S)-8-METHYL-8-AZABICYCLO[3.2.1]OCT-3-YL (2R)-3-HYDROXY-2-PHENYLPROPANOATE × 1 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；ammonium sulphate and PEG 4000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.23 Å R-free 0.204
2B17 Specific binding of non-steroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs) to phospholipase A2: Crystal structure of the complex formed between phospholipase A2 and diclofenac at 2.7 A resolution: 提交 2005-09-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 DIF 2-[2,6-DICHLOROPHENYL)AMINO]BENZENEACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；ammonium sulphate and PEG 4000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.71 Å R-free 0.211
2DO2 Design of specific inhibitors of phospholipase A2: Crystal structure of the complex formed between a group II Cys 49 phospholipase A2 and a designed pentapeptide Ala-Leu-Ala-Ser-Lys at 2.6A resolution 提交 2006-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；0.2M ammonium sulphate, PEG 4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.60 Å R-free 0.192
2DPZ Structure of the complex of phospholipase A2 with N-(4-hydroxyphenyl)- acetamide at 2.1 A resolution 提交 2006-05-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 TYL N-(4-HYDROXYPHENYL)ACETAMIDE (TYLENOL) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；0.2M ammonium sulphate, 30% PEG 4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.10 Å R-free 0.217
2FNX Design of Specific Peptide Inhibitors of Phospholipase A2 (PLA2): Crystal Structure of the Complex of PLA2 with a Highly Potent Peptide Val-Ile-Ala-Lys at 2.7A Resolution 提交 2006-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；0.2M ammonoium sulfate, 30% PEG4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.231
2G58 Crystal structure of a complex of phospholipase A2 with a designed peptide inhibitor Dehydro-Ile-Ala-Arg-Ser at 0.98 A resolution 提交 2006-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；297 K；0.2M AMMONIUM SULPHATE, 50% PEG, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
分辨率 0.98 Å R-free 0.157
2GNS Design of specific peptide inhibitors of phospholipase A2: Crystal structure of the complex formed between a group II phospholipase A2 and a designed pentapeptide Ala- Leu- Val- Tyr- Lys at 2.3 A resolution 提交 2006-04-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.2；298 K；0.2M ammonium sulphate, 30% PEG 4000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.212
2O1N Crystal structure of a complex of phospholipase A2 with a peptide Ala-Ile-Ala-Ser at 2.8 A resolution 提交 2006-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；PEG 4000, 0.2 M Ammonium Sulphate, sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.227
2OLI Crystal structure of the complex formed between a group II phospholipase A2 and an indole derivative at 2.2 A resolution 提交 2007-01-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 IOP INDOLYLPROPIONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；PEG 4000, Ammonium Sulphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.21 Å R-free 0.186
2OTF Crystal structure of the complex formed between phospholipase A2 and atenolol at 1.95 A resolution 提交 2007-02-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 2TN 2-(4-(2-HYDROXY-3-(ISOPROPYLAMINO)PROPOXY)PHENYL)ETHANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；Ammonium Sulphate, PEG 4000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.95 Å R-free 0.211
2OTH Crystal structure of a ternary complex of phospholipase A2 with indomethacin and nimesulide at 2.9 A resolution 提交 2007-02-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 NIM 4-NITRO-2-PHENOXYMETHANESULFONANILIDE × 1 IMN INDOMETHACIN × 1 CCN ACETONITRILE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；Ammonium Sulphate, PEG4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.90 Å R-free 0.232
2OUB Crystal structure of the complex formed between phospholipase A2 and atenolol at 2.75 A resolution 提交 2007-02-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 2TN 2-(4-(2-HYDROXY-3-(ISOPROPYLAMINO)PROPOXY)PHENYL)ETHANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；Ammonium sulphate, PEG 4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.75 Å R-free 0.237
2OYF Crystal Structure of the complex of phospholipase A2 with indole acetic acid at 1.2 A resolution 提交 2007-02-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 IAC 1H-INDOL-3-YLACETIC ACID × 1 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；300 K；0.2M ammonium sulphate, 30% PEG 4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K
分辨率 1.20 Å R-free 0.208
2PB8 Crystal structure of the complex formed between phospholipase A2 and peptide Ala-Val-Tyr-Ser at 2.0 A resolution 提交 2007-03-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；Acetate, 30% PEG4000, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.218
2PMJ Crystal structure of the complex formed between phospholipase A2 and 1, 2 benzopyrone at 2.4 A resolution 提交 2007-04-23 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 COU COUMARIN × 1 CCN ACETONITRILE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；0.2M Ammonium sulphate, 30% PEG 4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.40 Å R-free 0.200
2PVT Crystal structure of a new isoform of phospholipase A2 from russells viper at 2.1 A resolution 提交 2007-05-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–117（117 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；0.3M Ammonium sulphate, 30% PEG8000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.10 Å R-free 0.217
2PWS Crystal structure of the complex formed between phospholipase A2 and 2-(4-isobutyl-phenyl)-propionic acid at 2.2 A resolution 提交 2007-05-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa） 片段：phospholipase A2
未记录 IBP IBUPROFEN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；298 K；Ammonium Sulphate, PEG 4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.21 Å R-free 0.215
2PYC Crystal structure of a monomeric phospholipase A2 from Russell's viper at 1.5A resolution 提交 2007-05-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 3 SO4 SULFATE ION × 2 CCN ACETONITRILE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；Sodium acetate, PEG 4000, Acetonitrile, Ammonium sulphate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.50 Å R-free 0.216
2Q1P Crystal Structure of Phospholipase A2 complex with propanol at 1.5 A resolution 提交 2007-05-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 POL N-PROPANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；300 K；0.2M ammonium sulphate, 30% PEG 4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K
分辨率 1.50 Å R-free 0.205
2QHW Crystal structure of a complex of phospholipase A2 with a gramine derivative at 2.2 resolution 提交 2007-07-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 PZZ 3-{3-[(DIMETHYLAMINO)METHYL]-1H-INDOL-7-YL}PROPAN-1-OL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；Ammoniumu acetate, PEG 4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.21 Å R-free 0.189
2QU9 Crystal structure of the complex of group II phospholipase A2 with Eugenol 提交 2007-08-04 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 EUG 2-methoxy-4-[(1E)-prop-1-en-1-yl]phenol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；0.2M AMMONIUM SULPHATE, 30% PEG 4000, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.08 Å R-free 0.217
2QUE Saturation of substrate-binding site using two natural ligands: Crystal structure of a ternary complex of phospholipase A2 with anisic acid and ajmaline at 2.25 A resolution 提交 2007-08-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 AJM AJMALINE × 1 ANN 4-METHOXYBENZOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；0.2M Ammonium sulphate, 0.2M ammonium acetate, 30% PEG 4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.25 Å R-free 0.221
2QVD Identification of a potent anti-inflammatory agent from the natural extract of plant Cardiospermun helicacabum: Crystal structure of the complex of phospholipase A2 with Benzo(g)-1,3-benzodioxolo(5,6-a)quinolizinium, 5,6-dihydro-9,10-dimethoxy at 1.93 A resolution 提交 2007-08-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 BER BERBERINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；50mm Ammonium acetate, 0.2M ammonium sulphate, 30%PEG 4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.93 Å R-free 0.224
3CBI Crystal structure of the ternary complex of phospholipase A2 with ajmaline and anisic acid at 3.1 A resolution 提交 2008-02-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 AJM AJMALINE × 1 ANN 4-METHOXYBENZOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；0.2M AMMONIUM SULPHATE, 30% PEG-4K, 0.1M SODIUM ACETATE BUFFER, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.15 Å R-free 0.250
3CBI Crystal structure of the ternary complex of phospholipase A2 with ajmaline and anisic acid at 3.1 A resolution 提交 2008-02-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–121（121 aa）
未记录 AJM AJMALINE × 1 ANN 4-METHOXYBENZOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；0.2M AMMONIUM SULPHATE, 30% PEG-4K, 0.1M SODIUM ACETATE BUFFER, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.15 Å R-free 0.250
3CBI Crystal structure of the ternary complex of phospholipase A2 with ajmaline and anisic acid at 3.1 A resolution 提交 2008-02-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–121（121 aa）
未记录 AJM AJMALINE × 1 ANN 4-METHOXYBENZOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；0.2M AMMONIUM SULPHATE, 30% PEG-4K, 0.1M SODIUM ACETATE BUFFER, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.15 Å R-free 0.250
3CBI Crystal structure of the ternary complex of phospholipase A2 with ajmaline and anisic acid at 3.1 A resolution 提交 2008-02-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–121（121 aa）
未记录 AJM AJMALINE × 1 ANN 4-METHOXYBENZOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；0.2M AMMONIUM SULPHATE, 30% PEG-4K, 0.1M SODIUM ACETATE BUFFER, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.15 Å R-free 0.250
3G8F Crystal structure of the complex formed between a group II phospholipase A2 and designed peptide inhibitor carbobenzoxy-dehydro-val-ala-arg-ser at 1.2 A resolution 提交 2009-02-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.2M AMMONIUM SULPHATE, 30% PEG, CaCl2, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 1.25 Å R-free 0.210
3H1X Simultaneous inhibition of anti-coagulation and inflammation: Crystal structure of phospholipase A2 complexed with indomethacin at 1.4 A resolution reveals the presence of the new common ligand binding site 提交 2009-04-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–121（121 aa）
未记录 IMN INDOMETHACIN × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.3M AMMONIUM SULPHATE, 30% PEG 4000 , pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.40 Å R-free 0.207

共 52 个其他 PDB 条目、66 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PA28_DABRP
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–121； UniProt 1–121

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 2zbh

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 2zbh
下载 Download
▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2zbh
沉积日期 deposition_date2007-10-20
结构标题 titleCrystal structure of the complex of phospholipase A2 with Bavachalcone from Aerva lanata at 2.6 A resolution
关键词 keywords;complex, Daucosterol, Aerva lanata, phospholipse A2, Calcium, Hydrolase, Lipid degradation, Metal-binding, Neurotoxin, Presynaptic neurotoxin, Secreted, Toxin ;; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier15.23 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron14.51 Å
零角强度 I(0) i04098930.00
分子量 molecular_weight13953.0 kDa
排除体积 excluded_volume17296 ų
包络体积 envelope_volume20076 ų
水化壳体积 shell_volume11979 ų
包络直径 envelope_diameter51.8 Å
壳层 Rg shell_rg20.00 Å
包络 Rg envelope_rg14.85 Å
形状 Rg shape_rg14.49 Å
总 Rg total_rg15.70 Å
总原子数 total_atoms969
残基数 n_residues121
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax51.8 Å
Rg (实空间) rg_real15.18 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.41 Å
I(0) (实空间) i0_real4.0990e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.9350e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal15.19 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal4099000.0000
解质量估计 total_estimate0.7953
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary16.4 Å
偏度 Skewness skewness0.250
峰度 Kurtosis kurtosis-0.354
角度范围 angular_range— – 0.5000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha1096000.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.791; Stabil: 0.996; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.975; Smooth: 0.000
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd2zbha_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.133 — Phospholipase A2, PLA2
超家族 Superfamily superfamilya.133.1 — Phospholipase A2, PLA2
家族 Family familya.133.1.2 — Vertebrate phospholipase A2

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id2zbhA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology90 — Phospholipase A2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Phospholipase A2 domain
▶

8. 引用文献 (1)

▶

9. 文件与曲线 (10)