Escherichia coli
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 同源多聚体 | 蛋白 2 DNA 2 | ;DNA (5'-D(*DGP*DCP*DCP*DTP*DCP*DAP*DAP*DGP*DTP*DTP*DAP*DAP*DCP*DTP*DTP*DGP*DAP*DGP*DGP*DC)-3') ; × 2 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 GLYCEROL × 2 water × 4 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | SOXR_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–154； UniProt 1–154 |
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| 条目编号 entry_id | 2zhg |
| 沉积日期 deposition_date | 2008-02-05 |
| 结构标题 title | Crystal structure of SoxR in complex with DNA |
| 关键词 keywords | ;oxidative stress, MerR family, Activator, DNA-binding, Iron, Iron-sulfur, Metal-binding, Transcription, Transcription regulation, TRANSCRIPTION-DNA COMPLEX ;; TRANSCRIPTION/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 25.32 Å |
| Rg（电子密度） | 24.51 Å |
| 总 Rg | 25.29 Å |
| 原子数 | 2678 |
| 残基数 | 282 |
| 排除体积 | 45187 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2zhga_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.6 — Putative DNA-binding domain |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.6.1 — Putative DNA-binding domain |
| 家族 Family family | a.6.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | 2zhgA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 1660 — Multidrug-efflux Transporter Regulator; Chain: A; Domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — |