2zxx

Crystal structure of Cdt1/geminin complex

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Geminin

Mus musculus

UniProt O88513

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 DNA replication factor Cdt1 × 1 (Q8R4E9) water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 DNA replication factor Cdt1 × 1 (Q8R4E9) water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GEMI_MOUSE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–79; UniProt 79–157 作者链 B; PDB构建体 1–79; UniProt 79–157 作者链 D; PDB构建体 1–79; UniProt 79–157 作者链 E; PDB构建体 1–79; UniProt 79–157

DNA replication factor Cdt1

Mus musculus

UniProt Q8R4E9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 Geminin × 2 (O88513) water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 Geminin × 2 (O88513) water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CDT1_MOUSE
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–197; UniProt 172–368 作者链 F; PDB构建体 1–197; UniProt 172–368

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2zxx
沉积日期 deposition_date2009-01-08
结构标题 titleCrystal structure of Cdt1/geminin complex
关键词 keywords;COILED-COIL, Cell cycle, Coiled coil, DNA replication inhibitor, Phosphoprotein, DNA replication, DNA-binding, Nucleus, Proto-oncogene, Ubl conjugation, CELL CYCLE-REPLICATION COMPLEX ;; CELL CYCLE/REPLICATION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2zxx__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2zxx__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2zxx__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)29.20 Å
Rg(电子密度)28.88 Å
总 Rg29.35 Å
原子数2755
残基数325
排除体积49024 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2zxx__assembly_1__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2zxx__assembly_2__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd2zxxa_
类 Class classh — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold foldh.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamilyh.1.28 — Geminin coiled-coil domain
家族 Family familyh.1.28.1 — Geminin coiled-coil domain
结构域编号 domain_idd2zxxb_
类 Class classh — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold foldh.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamilyh.1.28 — Geminin coiled-coil domain
家族 Family familyh.1.28.1 — Geminin coiled-coil domain
结构域编号 domain_idd2zxxc_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamilya.4.5 — 'Winged helix' DNA-binding domain
家族 Family familya.4.5.52 — DNA replication factor Cdt1
结构域编号 domain_idd2zxxd_
类 Class classh — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold foldh.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamilyh.1.28 — Geminin coiled-coil domain
家族 Family familyh.1.28.1 — Geminin coiled-coil domain
结构域编号 domain_idd2zxxe_
类 Class classh — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold foldh.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamilyh.1.28 — Geminin coiled-coil domain
家族 Family familyh.1.28.1 — Geminin coiled-coil domain
结构域编号 domain_idd2zxxf_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamilya.4.5 — 'Winged helix' DNA-binding domain
家族 Family familya.4.5.52 — DNA replication factor Cdt1

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id2zxxA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1180 — Geminin coiled-coil domain
结构域编号 domain_id2zxxB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1180 — Geminin coiled-coil domain
结构域编号 domain_id2zxxD00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1180 — Geminin coiled-coil domain
结构域编号 domain_id2zxxE00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1180 — Geminin coiled-coil domain
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7. 引用文献 (1)