Methanothermobacter thermautotrophicus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | ;6-cyanouridine 5'-phosphate ; × 2 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | PYRF_METTH |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 4–231； UniProt 1–228 作者链 B； PDB构建体 4–231； UniProt 1–228 |
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| 条目编号 entry_id | 2zz5 |
| 沉积日期 deposition_date | 2009-02-05 |
| 结构标题 title | Orotidine Monophosphate Deacarboxylase D70A/K72A double mutant from M. thermoautotrophicum complexed with 6- cyano-UMP |
| 关键词 keywords | ;OROTIDINE 5'-MONOPHOSPHATE DECARBOXYLASE (ODCASE), 6-CYANOUMP OMP decarboxylase, OMPDC, OMPDCASE, Decarboxylase, Lyase, Pyrimidine biosynthesis ;; LYASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 22.31 Å |
| Rg（电子密度） | 21.01 Å |
| 总 Rg | 21.81 Å |
| 原子数 | 3266 |
| 残基数 | 427 |
| 排除体积 | 58083 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2zz5a_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.1 — TIM beta/alpha-barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.1.2 — Ribulose-phoshate binding barrel |
| 家族 Family family | c.1.2.3 — Decarboxylase |
| 结构域编号 domain_id | d2zz5b_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.1 — TIM beta/alpha-barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.1.2 — Ribulose-phoshate binding barrel |
| 家族 Family family | c.1.2.3 — Decarboxylase |
| 结构域编号 domain_id | 2zz5A00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Alpha-Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 20 — TIM Barrel |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 70 — Aldolase class I |
| 结构域编号 domain_id | 2zz5B00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Alpha-Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 20 — TIM Barrel |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 70 — Aldolase class I |