Human immunodeficiency virus 1
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | GLYCEROL × 1 ;(4R)-3-[(2S,3S)-3-{[(4-amino-2,6-dimethylphenoxy)acetyl]amino}-2-hydroxy-4-phenylbutanoyl]-5,5-dimethyl-N-(2-methylprop -2-en-1-yl)-1,3-thiazolidine-4-carboxamide ; × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | Q9EKL4_9HIV1 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 B； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 |
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| 条目编号 entry_id | 3a2o |
| 沉积日期 deposition_date | 2009-05-26 |
| 结构标题 title | Crystal Structure of HIV-1 Protease Complexed with KNI-1689 |
| 关键词 keywords | HIV-1 protease, Inhibitor, Aspartyl protease, Hydrolase, Protease, HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex; HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 18.21 Å |
| Rg（电子密度） | 17.20 Å |
| 总 Rg | 18.27 Å |
| 原子数 | 3219 |
| 残基数 | 198 |
| 排除体积 | 28551 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d3a2oa_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.50 — Acid proteases |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.50.1 — Acid proteases |
| 家族 Family family | b.50.1.1 — Retroviral protease (retropepsin) |
| 结构域编号 domain_id | d3a2ob_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.50 — Acid proteases |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.50.1 — Acid proteases |
| 家族 Family family | b.50.1.1 — Retroviral protease (retropepsin) |
| 结构域编号 domain_id | 3a2oA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Acid Proteases |
| 结构域编号 domain_id | 3a2oB00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Acid Proteases |