Mycobacterium smegmatis
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 同源多聚体 | 蛋白 4 DNA 2 | DNA (31-MER) × 2 water × 6 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | SSB_MYCS2 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 B； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 |
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| 条目编号 entry_id | 3a5u |
| 沉积日期 deposition_date | 2009-08-12 |
| 结构标题 title | Promiscuity and specificity in DNA binding to SSB: Insights from the structure of the Mycobacterium smegmatis SSB-ssDNA complex |
| 关键词 keywords | DNA binding protein, DNA damage, DNA repair, DNA replication, DNA-binding; DNA BINDING PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 24.99 Å |
| Rg（电子密度） | 23.37 Å |
| 总 Rg | 24.16 Å |
| 原子数 | 4326 |
| 残基数 | 522 |
| 排除体积 | 73076 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d3a5ua_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.40 — OB-fold |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.40.4 — Nucleic acid-binding proteins |
| 家族 Family family | b.40.4.3 — Single strand DNA-binding domain, SSB |
| 结构域编号 domain_id | d3a5ub_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.40 — OB-fold |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.40.4 — Nucleic acid-binding proteins |
| 家族 Family family | b.40.4.3 — Single strand DNA-binding domain, SSB |
| 结构域编号 domain_id | 3a5uA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 140 — Nucleic acid-binding proteins |
| 结构域编号 domain_id | 3a5uB00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 140 — Nucleic acid-binding proteins |