Pyrococcus horikoshii
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–RNA | 异源复合物 | 蛋白 2 RNA 1 | Putative uncharacterized protein PH1566 × 1 （O59282） ;RNA (5'-R(*GP*GP*AP*UP*CP*AP*CP*CP*UP*CP*C)-3') ; × 1 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | IF2A_PYRHO |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–275； UniProt 1–275 |
Pyrococcus horikoshii
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–RNA | 异源复合物 | 蛋白 2 RNA 1 | Translation initiation factor 2 subunit alpha × 1 （O58655） ;RNA (5'-R(*GP*GP*AP*UP*CP*AP*CP*CP*UP*CP*C)-3') ; × 1 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | O59282_PYRHO |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 1–219； UniProt 1–219 |
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| 条目编号 entry_id | 3aev |
| 沉积日期 deposition_date | 2010-02-10 |
| 结构标题 title | Crystal structure of a/eIF2alpha-aDim2p-rRNA complex from Pyrococcus horikoshii OT3 |
| 关键词 keywords | ;Proteins-rRNA complex, 16S rRNA, RNA-binding, RNA processing, Initiation factor, Protein biosynthesis, TRANSLATION-RNA BINDING PROTEIN-RNA complex ;; TRANSLATION/RNA BINDING PROTEIN/RNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 27.14 Å |
| Rg（电子密度） | 26.15 Å |
| 总 Rg | 26.88 Å |
| 原子数 | 3035 |
| 残基数 | 356 |
| 排除体积 | 53569 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d3aevb1 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.51 — Eukaryotic type KH-domain (KH-domain type I) |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.51.1 — Eukaryotic type KH-domain (KH-domain type I) |
| 家族 Family family | d.51.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d3aevb2 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.51 — Eukaryotic type KH-domain (KH-domain type I) |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.51.1 — Eukaryotic type KH-domain (KH-domain type I) |
| 家族 Family family | d.51.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | 3aevA01 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 140 — Nucleic acid-binding proteins |
| 结构域编号 domain_id | 3aevA02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 150 — DNA polymerase; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 190 — Translation initiation factor 2; subunit 1; domain 2 |
| 结构域编号 domain_id | 3aevB01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 1370 — Ribosomal Protein S8; Chain: A, domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — K Homology domain, type 1 |
| 结构域编号 domain_id | 3aevB02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 1370 — Ribosomal Protein S8; Chain: A, domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — K Homology domain, type 1 |