Bacillus subtilis
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–RNA | 同源多聚体 | 蛋白 6 RNA 1 | 5'-R(*AP*GP*AP*GP*AP*G)-3' × 1 water × 7 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | HFQ_BACSU |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 6–78； UniProt 1–73 作者链 B； PDB构建体 6–78； UniProt 1–73 作者链 C； PDB构建体 6–78； UniProt 1–73 |
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| 条目编号 entry_id | 3ahu |
| 沉积日期 deposition_date | 2010-04-29 |
| 结构标题 title | Crystal structure of YmaH (Hfq) from Bacillus subtilis in complex with an RNA aptamer. |
| 关键词 keywords | Sm-like motif, Protein-RNA complex, TRANSLATION-RNA complex; TRANSLATION/RNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 23.92 Å |
| Rg（电子密度） | 22.53 Å |
| 总 Rg | 23.56 Å |
| 原子数 | 3390 |
| 残基数 | 402 |
| 排除体积 | 60193 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d3ahua_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.38 — Sm-like fold |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.38.1 — Sm-like ribonucleoproteins |
| 家族 Family family | b.38.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d3ahub_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.38 — Sm-like fold |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.38.1 — Sm-like ribonucleoproteins |
| 家族 Family family | b.38.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d3ahuc_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.38 — Sm-like fold |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.38.1 — Sm-like ribonucleoproteins |
| 家族 Family family | b.38.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | 3ahuA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 30 — SH3 type barrels. |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 100 — |
| 结构域编号 domain_id | 3ahuB00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 30 — SH3 type barrels. |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 100 — |
| 结构域编号 domain_id | 3ahuC00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 30 — SH3 type barrels. |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 100 — |